PPGCB - Mestrado em Ciências Biológicas

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Biodegradação de hidrocarbonetos aromáticos policíclicos: prospecção metagenômica e modelagem computacional 3-D de proteínas
(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2011-05-23) Sousa, Bruno Gomes de; Fulco, Umberto Laino; Blaha, Carlos Alfredo Galindo; ; http://lattes.cnpq.br/2307806644081146; ; http://lattes.cnpq.br/9579151361576173; ; http://lattes.cnpq.br/8255679020994527; Albuquerque, Eudenilson Lins de; ; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783172H5; Almeida, Paulo Fernando de; ; http://lattes.cnpq.br/8972128111026703
O conhecimento sobre os procariotos nativos em locais de risco favorece a aplicação de biotecnologias para biorremediação. Estratégias independentes de cultivo, como metagenômica, contribuem para aprofundar o conhecimento microbiológico, possibilitando estudos com organismos não cultiváveis acerca do status microbiológico nativo e seu potencial papel na biodegradação de, por exemplo, Hidrocarbonetos Aromáticos Policíclicos (HAP s). Considerando o bioma de mangue uma interface frágil e crítica de fronteira com o oceano, este trabalho caracteriza a microbiota nativa de mangue com potencial biodegradador de HAP s utilizando um biomarcador molecular para detecção e avaliação da diversidade bacteriana em áreas sob influência de indústrias petrolíferas através da PCR-DGGE na Bacia Petrolífera Potiguar (BPP). Foi escolhido um biomarcador molecular metabólico, enzima PcaF, para detecção de procariotos degradadores de HAP s. Com o biomarcador, fingerprints foram obtidos de amostras de Paracuru-CE, Fortim-CE e Areia Branca-RN, revelando a ocorrência de flutuações das comunidades microbianas de acordo com os períodos de amostragem e em resposta ao impacto por petróleo. Através da análise das comunidades microbianas frente à interferência da indústria do petróleo, em Areia Branca-RN e Paracuru-CE foi observado que o petróleo é determinante para a diversidade microbiana. Fortim-CE provavelmente não tem influência direta da atividade petrolífera. No intuito de obter dados para o melhor entendimento do transporte e biodegradação de HAP s, foram desenvolvidos estudos in silico de modelagem e simulação computacional a partir da obtenção de modelos 3-D de proteínas envolvidas na degradação do fenantreno, no transporte de HAP s e também a obtenção do modelo 3-D da enzima PcaF. Estudos de dockings com substratos e produtos forneceram dados para o melhor entendimento sobre o mecanismo de transporte e catálise de HAP s
Ecogenômica de archaea e monitoramento de comunidades de procariotos redutores de sulfato: aplicações na indústria de petróleo e gás
(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2008-03-14) Carvalho, Ciáxares Magalhães; Corso, Gilberto; Blaha, Carlos Alfredo Galindo; ; http://lattes.cnpq.br/2307806644081146; ; http://lattes.cnpq.br/0274040885278760; ; http://lattes.cnpq.br/6350343242189886; Rocha, Hugo Alexandre de Oliveira; ; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4799567J8&dataRevisao=null; Almeida, Paulo Fernando de; ; http://lattes.cnpq.br/8972128111026703
São diversas as atividades humanas responsáveis pela degradação ambiental observada no mundo moderno. As atividades industriais são preponderantes na questão das conseqüências impactantes para os ecossistemas brasileiros. Entre as atividades antrópicas, a indústria petrolífera atuante na Bacia Petrolífera Potiguar (BPP), expõe a risco constante de impactos ambientais nos municípios integrantes, não só as populações humanas e o meio ambiente, mas também atinge os microrganismos nativos do solo da Caatinga e no sedimento do manguezal. Não obstante, a elaboração de estratégias de biorremediação de áreas impactadas perpassa, dentre outros aspectos, pelo conhecimento da microbiota e suas relações com o meio. Entre os grupos de microrganismos associados ao petróleo, destacam-se os procariotos redutores de sulfato (PRS) que, em seu metabolismo anaeróbico, participam da redução do sulfato, liberando gás sulfídrico, causando riscos ambientais e ocasionando a corrosão de superfícies, como tubulações e tanques, resultando em prejuízos para a indústria. Algumas linhagens de PRS integram o domínio Archaea, grupo de microrganismos cujos genomas seqüenciados apresentam predominância de adaptações extremofílicas, incluindo ambientes com presença de petróleo. Este trabalho tem dois objetivos correlacionados: i) detectar e monitorar o gene dsrB, presente em procariotos redutores de sulfato, por perfis de DGGE gerados a partir de amostras ambientais de mDNA do manguezal de Diogo Lopes, e do solo do semi-árido da região da BPP; ii) relacionar características genômicas aos aspectos ecológicos de Archaea, ressaltando sua importância para a indústria do petróleo, através de estudos in silico. Os resultados do primeiro trabalho sugerem que as comunidades petrodegradadoras de PRS persistem após a contaminação por petróleo em sedimento de manguezal e do solo do semiárido. A comparação entre as populações dos dois locais de amostragem revela que as mesmas apresentam variações em seu tamanho e composição ao longo de um ano de experimento. No segundo trabalho especula-se que fatores funcionais e estruturais são a causa da pressão para a manutenção da conservação das seqüências nas múltiplas cópias do gene 16S rDNA. Verifica-se também a discrepância observada entre o conteúdo GC total e conteúdo GC do mesmo gene. Tais resultados relacionando genes ribossomais a fatores ambientais são importantes para avaliações metagenômicas empregando PCR-DGGE. O conhecimento da microbiota associada ao petróleo pode contribuir para uma melhor destinação de recursos por parte da indústria petrolífera e o desenvolvimento de estratégias de biorremediação. Outrossim, busca contribuir para o melhor entendimento da atuação da microbiota nativa nos ciclos biogeoquímicos em ecossistemas da Bacia Petrolífera Potiguar

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Navegando PPGCB - Mestrado em Ciências Biológicas por Autor "Almeida, Paulo Fernando de"