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Título: A influência do esqueleto açúcar-fostato no transporte da molécula de DNA
Autor(es): Sarmento, Ricardo Gondim
Palavras-chave: DNA;Esqueleto açúcar-fosfato;Transporte eletrônico;Fitas duplas;Seqüência quasi-periódica;Cromossomo 22;Genoma humano;DNA;Sugar-phosphate structure;Electronic transport;Double stretch;Quasi-periodic sequences;Ch22;Human genome
Data do documento: 30-Set-2008
Editor: Universidade Federal do Rio Grande do Norte
Citação: SARMENTO, Ricardo Gondim. A influência do esqueleto açúcar-fostato no transporte da molécula de DNA. 2008. 86 f. Dissertação (Mestrado em Física da Matéria Condensada; Astrofísica e Cosmologia; Física da Ionosfera) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2008.
Resumo: This dissertation analyses the influence of sugar-phosphate structure in the electronic transport in the double stretch DNA molecule, with the sequence of the base pairs modeled by two types of quasi-periodic sequences: Rudin-Shapiro and Fibonacci. For the sequences, the density of state was calculated and it was compared with the density of state of a piece of human DNA Ch22. After, the electronic transmittance was investigated. In both situations, the Hamiltonians are different. On the analysis of density of state, it was employed the Dyson equation. On the transmittance, the time independent Schrödinger equation was used. In both cases, the tight-binding model was applied. The density of states obtained through Rudin-Shapiro sequence reveal to be similar to the density of state for the Ch22. And for transmittance only until the fifth generation of the Fibonacci sequence was acquired. We have considered long range correlations in both transport mechanism
metadata.dc.description.resumo: Esta dissertação analisa a influência do esqueleto açúcar-fosfato no transporte eletrônico na molécula de DNA de fita dupla, com o sequenciamento dos pares de base modelado por dois tipos de seqüências quasi-periódicas: Rudin-Shapiro e Fibonacci. Para ambas as seqüências, foram calculadas as densidades de estado e comparadas com a densidade de estado de um trecho do DNA humano Ch 22. Em seguida, foi investigada a transmitância eletrônica. Nos dois casos, as Hamiltonianas são distintas. Na análise da densidade de estado foi empregada a equação de Dyson. Na transmitância foi feito uso da equação de Schrödinger independente do tempo. Em ambos os casos, foi utilizado o modelo tight-binding. Os resultados para a densidade de estado foram mais satisfatórios para a seqüência de Rudin-Shapiro, que forneceu um perfil muito próximo do perfil da densidade de estado para o Ch22. A transmitância foi calculada somente para a seqüência de Fibonacci atá a quinta geração. Nestes dois mecanismos de transporte, as correlações são de longo alcance
URI: http://repositorio.ufrn.br:8080/jspui/handle/123456789/16543
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