Navegando por Autor "Nascimento, Vladimir Vieira do"
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Dissertação Estudo da influência do voo com o foguete VSB-30 no transcriptoma de plantas de Saccharum spp. (cana-de-açúcar)(2017-05-26) Nascimento, Vladimir Vieira do; Scortecci, Katia Castanho; ; ; Lima, João Paulo Matos Santos; ; Calsa Júnior, Tercilio;Com a submissão de plantas de cana-de-açúcar em um voo realizado com o foguete VSB-30, puderam-se observar alterações histológicas e bioquímicas nos tecidos de folhas e de raízes. Por isto, neste trabalho, o nosso objetivo foi avaliar o transcriptoma, para com isso identificar nos tecidos de folhas e raízes possíveis respostas relacionadas à condição de voo com o foguete VSB-30. Para isso, inicialmente, foi utilizado o pacote DESeq o qual permitiu detectar 118 Transcritos Expressos Diferencialmente, que possuíam valores de Log2FoldChange ≥2 ou ≤−2. Com a aplicação do método blind, as comparações que foram realizadas entre as amostras dos grupos Teste de voo com o foguete VSB-30 e Controle permitiram verificar que as maiores sensibilidades ocorreram em amostras de tecidos de raízes, visto que foram detectados 77 transcritos específicos. Estes dados ao serem submetidos à ferramenta STRING v.10 retornaram redes de interação de proteínas ortólogas que foram formadas a partir do organismo de referência Sorghum bicolor. Diante disso, as análises de biologia de sistemas que foram realizadas no programa Cytoscape v.3.4 possibilitaram identificar que nas amostras de tecidos de raízes ocorreram alterações no Processamento de Informações, com induções relacionadas aos processos biológicos de tradução de proteínas. Na amostra de Raiz Foguete Vertical também foram observadas respostas específicas que foram relacionadas às condições de microgravidade e hipergravidade. Pois estas podem ser interpretadas pelos sistemas biológicos como uma condição de estresse abiótico. O que poderia resultar em indução nos processos biológicos que envolvem o proteossoma ativo e repressão na maturação de ribossomos. Isto, possivelmente, culminaria em um aumento na degradação de proteínas oxidadas e parada da progressão do ciclo celular. Por outro lado, nas amostras de tecidos de folhas surgiram como possíveis respostas ao experimento realizado uma indução no processo biológico de transcrição. Na amostra de Folha Foguete Vertical, também foi detectada uma possível indução na via metabólica de degradação e descarboxilação de glicina. Com tudo isso, infere-se que todos esses resultados compreendam as principais respostas metabólicas relacionadas ao voo realizado com o foguete VSB-30, que apresenta ambientes transitórios de microgravidade e hipergravidade, que em plantas podem ser interpretados como uma condição de estresse ambiental.TCC Estudo do transcriptoma de plantas cana-de-açúcar submetidas às condições de microgravidade e hipergravidade por meio do voo realizado com o foguete vsb-30(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2018-11-30) Nascimento, Vladimir Vieira do; Scortecci, Katia Castanho; Medeiros, Nathália Maíra Cabral de; Almeida, Felipe de LimaA cana-de-açúcar é uma planta da família Poaceae, que pode ser utilizada como fonte de energia. Diante disso, atualmente, se encontra cultivada em diversas regiões tropicais e subtropicais e apresenta uma área de cultivo que foi estimada em 40,9 milhões de hectares, onde diversos fatores ambientais influenciam no seu desenvolvimento, que dependendo da intensidade configuram um estresse. Nesse contexto, uma variação na ordem de grandeza da gravidade, também configura um estresse nas plantas. Com isso, no presente trabalho avaliou-se alterações no transcriptoma de canas-de-açúcar submetidas a condições de microgravidade e hipergravidade, mediante um voo realizado com o foguete VSB-30. Com este material foi realizado o sequenciamento de RNA utilizando a plataforma Illumina. As análises realizadas para as amostras de folha e raiz, possibilitaram detectar Transcritos Expressos Diferencialmente (Log2FoldChange ≥2 ou ≤−2), por meio da execução do pacote de análise de expressão diferencial DESeq. Estes dados ao serem submetidos à base de dados STRING v.10.5, também permitiram obter redes de proteínas ortólogas de Sorghum bicolor. À vista disso, nas amostras que foram dispostas em posição vertical no experimento, foi verificado que no tecido de raiz ocorreram possíveis alterações nos processos biológicos de manutenção dos telômeros, devido à repressão nos níveis do transcrito RIBONUCLEOPROTEIN COMPLEX SUBUNIT 3-LIKE PROTEIN. E nas amostras de tecidos de folha observou-se uma provável indução de STACHYOSE SYNTHASE, que envolve-se no metabolismo de oligossacarídeos da família da rafinose, e em respostas a condição de estresse. Por outro lado, nas amostras que foram dispostas em posição horizontal, detectou-se para o tecido de raiz uma repressão nos níveis dos transcritos EXOSOME COMPLEX COMPONENT RRP41 HOMOLOG e CYCLOARTENOL SYNTHASE, que apresenta processos biológicos relacionados ao metabolismo do cicloartenol que é um precursor de fito esteróis. Enquanto que na amostra de tecido de folha, observou-se a indução do perfil transcricional de RPL32, que em plantas pode afetar o processamento de informações genéticas, que implica em modificações no processo biológico de tradução. Com isso, tais dados permitem concluir que as condições de microgravidade e hipergravidade promoveram alterações no transcriptoma de cana-de-açúcar de forma tecido-específica, o que modifica em tecido de raiz processos biológicos relacionados à biossíntese de lipídeos, replicação e degradação de RNAm e em tecido de folha a biossíntese de carboidratos e de tradução que pode comprometer a divisão celular. Este trabalho, também apontou uma relevância para a disposição espacial do organismo no experimento. Dado que, as análises efetuadas demonstraram respostas específicas para as amostras dispostas em posição vertical e horizontal.