Navegando por Autor "Santos, Gabrielle Germek Coelho"
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TCC Estudo metagenômico microbiano em transportes públicos circulantes na região metropolitana de Natal/RN durante o inverno(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2023-07-14) Santos, Gabrielle Germek Coelho; Medeiros, Sílvia Regina Batistuzzo de; Felipe, Maria Beatriz Mesquita Cansanção; http://lattes.cnpq.br/3673464953672300; https://orcid.org/0000-0003-2431-0479; http://lattes.cnpq.br/5882662534904226; http://lattes.cnpq.br/0824213140689567; Araújo, Josélio Maria Galvão de; https://orcid.org/0000-0003-3548-2786; http://lattes.cnpq.br/6430774978643765; Minnicelli, Carolina Fonseca; https://orcid.org/0000-0002-5994-1513; http://lattes.cnpq.br/0236314764075499O conhecimento sobre microrganismos cresce cada vez mais, em virtude da sua grande relevância no âmbito científico e da saúde. A diversidade microbiana é bastante ampla, porém, ainda que existam microrganismos com propriedades benéficas para com outros organismos, há aqueles que representam ameaça à saúde humana, tornando-os alvos de estudos e estratégias para seu combate e controle. No entanto, pouco se sabe sobre a presença de microrganismos e suas interações em espaços urbanos, principalmente em sistemas de transporte público. O presente trabalho teve como objetivo a identificação da comunidade microbiana existente nos ônibus circulantes no município de Natal/RN. Para tal, foram realizadas coletas de amostras nas superfícies de 67 ônibus distribuídos em várias linhas que circulam pela cidade durante o período de inverno (18/07/2022 até 21/09/2022). Executou-se a extração do material genético viral e bacteriano, e a checagem do seu rendimento e pureza no NanoDrop e Qubit. Foram feitas as bibliotecas genômicas, e seus rendimentos analisados no Qubit e Bioanalyzer. O sequenciamento foi realizado pelo Illumina NextSeq 1000 e as análises iniciais em Bioinformática foram efetuadas na plataforma KBase. Os resultados parciais revelaram baixas concentrações e rendimentos das amostras pós-extração, tendo apenas três amostras com valores suficientemente bons para elaboração das bibliotecas (DNA Bac A2: 0,18 ng/µL; DNA Viral A2: 0,04 ng/µL; DNA Bac B: 0,46 ng/µL). Contudo, ao analisar os perfis das bibliotecas genômicas pós-sequenciamento e seus dados estatísticos, observou-se qualidades significativas dessas bibliotecas. O número de sequências para DNA bacteriano A2, DNA Viral A2 e DNA Bacteriano B foi de 14.844.879, 18.805.942 e 18.288.666, respectivamente, e seus valores N50, após a montagem, foram de 12.528, 5.769 e 17.553. Estas características indicam bons parâmetros para a continuidade do projeto, em que será realizada a taxonomia das amostras, abundância e diversidade dos taxa in silico e suas correlações com dados relativos a temperatura, umidade e epidemiologia.