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Navegando por Autor "Silva, Larissa Martins Brito e"

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    Dissertação
    Montagem e anotação de genomas mitocondriais amazônicos a partir de dados públicos disponíveis no NCBI
    (Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2025-04-11) Silva, Larissa Martins Brito e; Souza, Jorge Estefano de Santana; Souza, Iara Dantas de; https://orcid.org/0000-0003-2347-042X; http://lattes.cnpq.br/8058577659019910; http://lattes.cnpq.br/1129701706757946; Faustino, André Luís Fonseca; Koroiva, Ricardo
    Os avanços tecnológicos nos últimos anos permitiram o desenvolvimento de tecnologias que facilitaram o sequenciamento e armazenamento de dados genômicos em bancos de dados públicos, como o NCBI. Entretanto, espécies do Sul Global, especificamente espécies amazônicas, são pouco representadas nos bancos de dados públicos. Dessa forma, para reduzir essa lacuna, este estudo tem o objetivo de montar e anotar 100 genomas mitocondriais de peixes amazônicos utilizando dados públicos disponíveis no NCBI, contribuindo com dados de 22 novas espécies que não estavam presentes no GenBank. A precisão das montagens foram validadas por meio de comparações de identidade de sequência com mitogenomas de referência, alcançando até 100% de identidade para a espécie Pygocentrus nattereri (Kner, 1858). Além disso, também encontrou-se possíveis erros de rotulagem de espécies presentes nos bancos de dados públicos. Ao expandir os dados genômicos de peixes amazônicos, este estudo ajuda a preencher lacunas significativas nos bancos de dados genômicos, contribuindo com novos estudos de conservação, gestão sustentável da pesca e biodiversidade de peixes amazônicos. Além de disponibilizar os resultados em bancos de dados públicos, os dados também serão depositados em um site dedicado a reunir dados genômicos de espécies amazônicas com o objetivo de democratizar o acesso a dados genômicos.
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