Navegando por Autor "Silva, Marcos Guilherme da Costa"
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TCC Análise comparativa de metagenomas de transportes públicos(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2025-01-17) Silva, Marcos Guilherme da Costa; Medeiros, Silvia Regina Batistuzzo de; https://orcid.org/0000-0003-2431-0479; http://lattes.cnpq.br/5882662534904226; http://lattes.cnpq.br/7243708323682768; Dalmolin, Rodrigo Juliani Siqueira; https://orcid.org/0000-0002-1688-6155; http://lattes.cnpq.br/4065178015615979; Felipe, Maria Beatriz Mesquita Cansanção; http://lattes.cnpq.br/3673464953672300Transportes públicos são áreas de alto fluxo de pessoas e densidade populacional, elementos característicos do ambiente urbano, e constituem ecossistemas complexos de microrganismos influenciados pelo movimento humano. O grande trânsito de pessoas viabiliza o transporte de microrganismos patogênicos como vírus e bactérias. O fluxo de organismos patogênicos tem estado em voga devido à recente pandemia, bem como pelo abundante fluxo de diversos tipos de bactérias responsáveis pela maioria das doenças infecciosas emergentes. Os métodos de análise da área de metagenômica são eficientes devido a sua capacidade de estudo sem necessidade de cultivo, aliado a isso, temos o uso do sequenciamento de próxima geração (do inglês, NGS) como alternativa para análise de grandes quantidades de organismos diversos e permitindo uma gama de manipulações de dados por meio do uso de ferramentas de bioinformática, sendo um avanço para análises taxonômicas e de anotação funcional. Em 2015, foi fundado o consórcio internacional Metadesign of the Subways and Urban Biomes (MetaSUB), visando coletar, isolar e sequenciar amostras coletadas de transportes públicos, contendo em seu banco de dados, aberto ao público, 5936 amostras de mais de 70 cidades em 28 países. Recentemente, um grupo de pesquisa do Laboratório de Biologia Molecular e Genômica (LBMG) da UFRN realizou um estudo com a coleta de amostras de swabs do interior de ônibus para identificação do microbioma dos transportes públicos de Natal, resultando em sequências de material genético que traçam um panorama dos organismos encontrados nesses ambientes na cidade. Este estudo propõe a observação dos microrganismos do interior de transportes públicos em 9 cidades ao redor do mundo, disponibilizadas pelo banco de dados do consórcio MetaSUB, e a comparação dos resultados dos transportes da cidade de Natal, visando determinar as semelhanças e discrepâncias entre os microbiomas estudados, tendo como resultado que cerca de 31% dos organismos aparecem em todas as cidades selecionadas, com essa proporção refletindo as espécies mais encontradas de forma geral. Cutibacterium acnes é a espécie mais abundante na maioria das regiões. Bactérias são predominantes, com destaque para o grupo ESKAPE dentre as de maior risco à saúde. O microbioma de Natal corresponde ao esperado para o ambiente analisado, com média próxima a 1.0e+07 de leituras por amostra, a segunda maior, e presença significativa das espécies Lawsonella clevelandensis e Phreatobacter oligotrophus, incomuns em relação às cidades vistas.