Importância da análise da expressão gênica em tecidos e células-únicas no estudo das neurociências: do desenvolvimento do neocórtex ao estudo da doença de Alzheimer

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dc.contributor.advisorCosta, Marcos Romualdo
dc.contributor.advisor-co1Souza, Sandro José de
dc.contributor.advisor-co1IDpt_BR
dc.contributor.advisor-co1Latteshttp://lattes.cnpq.br/8479967495464590pt_BR
dc.contributor.advisorIDpt_BR
dc.contributor.advisorLatteshttp://lattes.cnpq.br/6118493598074445pt_BR
dc.contributor.authorCoelho, Diego Marques
dc.contributor.authorIDpt_BR
dc.contributor.authorLatteshttp://lattes.cnpq.br/2074007934768692pt_BR
dc.contributor.referees1Lourenço, Mychael Vinícius da Costa
dc.contributor.referees1IDpt_BR
dc.contributor.referees1Latteshttp://lattes.cnpq.br/4749634096638221pt_BR
dc.contributor.referees2Garcez, Patricia Pestana
dc.contributor.referees2IDpt_BR
dc.contributor.referees2Latteshttp://lattes.cnpq.br/7284551536353300pt_BR
dc.contributor.referees3Dalmolin, Rodrigo Juliani Siqueira
dc.contributor.referees3IDpt_BR
dc.contributor.referees3Latteshttp://lattes.cnpq.br/4065178015615979pt_BR
dc.contributor.referees4Velho, Tarciso André Ferreira
dc.contributor.referees4IDpt_BR
dc.contributor.referees4Latteshttp://lattes.cnpq.br/8194534389725093pt_BR
dc.date.accessioned2021-08-23T19:29:03Z
dc.date.available2021-08-23T19:29:03Z
dc.date.issued2021-05-31
dc.description.resumoO sequenciamento de RNA mensageiro em larga escala (RNAseq) permite avaliar a diversidade de transcritos expressos em um determinado momento de um sistema biológico. Através da bioinformática, podemos analisar os dados de sequenciamento para obter informações quantitativas sobre a expressão gênica, tais como a expressão diferencial de genes e suas isoformas (splices alternativos). Nesta tese, apresentamos dois estudos independentes que se valeram da bioinformática para obter informações relevantes sobre diferentes fenômenos biológicos. No primeiro caso, nós utilizamos dados de sequenciamento de RNAm em cérebros de pacientes com a doença de Alzheimer para estudar a expressão diferencial de genes e transcritos associadas com a progressão desta doença. Nós demonstramos que a análise de transcritos permite a identificação de alterações gênicas ignoradas em estudos anteriores avaliando apenas a expressão global dos genes. Utilizando dados de sequenciamento de RNAm em células únicas (scRNAseq), nós também mapeamos as alterações da expressão gênica no cérebro de pacientes com a doença de Alzheimer para tipos celulares específicos. Os resultados deste primeiro trabalho contribuem para uma melhor compreensão da patofisiologia da doença de Alzheimer e indicam potenciais alterações moleculares associadas com a doença em tipos celulares individuais. No segundo trabalho desenvolvido nesta tese, nós utilizamos a técnica de scRNAseq para estudar a diversidade de células progenitoras em estágios iniciais do desenvolvimento do neocórtex. Através de análises de expressão diferencial de genes e a utilização de uma abordagem utilizando redes de regulação da expressão gênica, nós identificamos o fator de transcrição Sox9 como um regulador-mestre do comportamento de diferentes subtipos de progenitores neurais. Confirmando estes achados da bioinformática, experimentos genéticos para manipular os níveis de expressão de Sox9 em progenitores neurais demonstraram a importância deste fator de transcrição na regulação da proliferação e diferenciação celular. Em conjunto, os resultados desta tese demonstram a importância da análise transcriptômica através de métodos complementares para uma melhor identificação das alterações da expressão gênica relevantes em diferentes contextos biológicos.pt_BR
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESpt_BR
dc.identifier.citationCOELHO, Diego Marques. Importância da análise da expressão gênica em tecidos e células-únicas no estudo das neurociências: do desenvolvimento do neocórtex ao estudo da doença de Alzheimer. 2021. 205f. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Instituto Metrópole Digital, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2021.pt_BR
dc.identifier.urihttps://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/33237
dc.languagept_BRpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal do Rio Grande do Nortept_BR
dc.publisher.countryBrasilpt_BR
dc.publisher.initialsUFRNpt_BR
dc.publisher.programPROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOINFORMÁTICApt_BR
dc.rightsAcesso Abertopt_BR
dc.subjectTranscriptômicapt_BR
dc.subjectAnálise da expressão gênicapt_BR
dc.subjectDoença de Alzheimerpt_BR
dc.subjectDesenvolvimento do neocórtexpt_BR
dc.subjectscRNAseqpt_BR
dc.titleImportância da análise da expressão gênica em tecidos e células-únicas no estudo das neurociências: do desenvolvimento do neocórtex ao estudo da doença de Alzheimerpt_BR
dc.typedoctoralThesispt_BR

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