Caracterização de uma nova exonuclease identificada em uma biblioteca metagenômica
| dc.contributor.advisor-co1 | Fuchs, Robert P. | |
| dc.contributor.advisorID | pt_BR | |
| dc.contributor.advisorLattes | http://lattes.cnpq.br/1083882171718362 | |
| dc.contributor.author | Silva, Rita de Cássia Barreto da | |
| dc.contributor.authorID | pt_BR | |
| dc.contributor.authorLattes | http://lattes.cnpq.br/2488757427439903 | |
| dc.contributor.referees1 | Uchôa, Adriana Ferreira | |
| dc.contributor.referees1ID | pt_BR | |
| dc.contributor.referees1Lattes | http://lattes.cnpq.br/6644671747055211 | |
| dc.contributor.referees2 | Scortecci, Katia Castanho | |
| dc.contributor.referees2ID | pt_BR | |
| dc.contributor.referees2Lattes | http://lattes.cnpq.br/4808910380593455 | |
| dc.contributor.referees3 | Machado, Carlos Renato | |
| dc.contributor.referees3ID | pt_BR | |
| dc.contributor.referees3Lattes | http://lattes.cnpq.br/6306925202374274 | |
| dc.contributor.referees4 | Henriques, Joao Antonio Pêgas | |
| dc.contributor.referees4ID | pt_BR | |
| dc.contributor.referees4Lattes | http://lattes.cnpq.br/0251361943436465 | |
| dc.date.accessioned | 2015-11-16T15:20:00Z | |
| dc.date.issued | 2014-03-27 | |
| dc.description.embargo | 2019-05-27 | |
| dc.description.resumo | A abordagem metagenômica tem permitido o acesso ao material genético de microrganismos não cultivados e tem sido usada para identificação de novos genes. Apesar da importância dos mecanismos de reparo de DNA para a manutenção da integridade genômica nosso conhecimento sobre mecanismos de reparo de DNA é baseado em organismos modelo como E. coli e pouco é conhecido sobre os organismos de vida livre e não cultivados. Neste trabalho, a abordagem metagenômica foi aplicada para descobrir novos genes envolvidos com a manutenção da integridade genômica. Um clone positivo foi identificado por replicar a biblioteca metagenômica em meio seletivo contendo H2O2. O clone metagenômico foi capaz de complementar parcialmente a deficiência em reparo de DNA de cepas simples e duplo-mutantes de E.coli (recA e xthA nfo, respectivamente) submetidas ao estresse gerado por H2O2 e MMS.A análise de sequência mostrou uma ORF codificando para uma proteína hipotética membro da superfamília Exo_Endo_Phos (PF03372) e, a filogenia indicou que a mesma não está inclusa em nenhuma das subfamílias EEP. Assim, uma nova nuclease foi identificada e experimentalmente caracterizada in vivo e in vitro. Ensaios específicos utilizando a nuclease purificada e oligonucleotideos fluorescentemente marcados revelaram sua atividade 3´-5´exonuclease, em substratos simples e dupla-fita, dependente de Magnésio e sensível a EDTA. Uma vez que este é o primeiro relato e caracterização de uma enzima obtida a partir de abordagem metagenômica mostrando uma atividade exonuclease, foi nomeada EXOMEG1 | pt_BR |
| dc.identifier.citation | SILVA, Rita de Cássia Barreto da. Caracterização de uma nova exonuclease identificada em uma biblioteca metagenômica. 2014. 118f. Tese (Doutorado em Ciências da Saúde) - Centro de Ciências da Saúde, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2014. | pt_BR |
| dc.identifier.uri | https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/19374 | |
| dc.language.iso | por | pt_BR |
| dc.publisher | Universidade Federal do Rio Grande do Norte | pt_BR |
| dc.publisher.country | Brasil | pt_BR |
| dc.publisher.initials | UFRN | pt_BR |
| dc.publisher.program | PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM CIÊNCIAS DA SAÚDE | pt_BR |
| dc.rights | Acesso Aberto | pt_BR |
| dc.subject | Metagenoma | pt_BR |
| dc.subject | Exonuclease | pt_BR |
| dc.subject | Reparo de DNA | pt_BR |
| dc.subject | Endonuclease | pt_BR |
| dc.title | Caracterização de uma nova exonuclease identificada em uma biblioteca metagenômica | pt_BR |
| dc.type | doctoralThesis | pt_BR |
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