Plataforma integrada para pesquisa e análise de compostos promissores para o tratamento da leishmaniose: LeishMolDB

dc.contributor.advisorBarbosa, Euzébio Guimarães
dc.contributor.advisorLatteshttp://lattes.cnpq.br/3197108792266393pt_BR
dc.contributor.authorPinto, Samara Beatriz de Abreu
dc.contributor.authorLatteshttp://lattes.cnpq.br/0482592824667427pt_BR
dc.contributor.referees1Jordão, Alessandro Kappel
dc.contributor.referees1Latteshttps://lattes.cnpq.br/2003461080025290pt_BR
dc.contributor.referees2Cunha, Dannilo Martins
dc.contributor.referees2Latteshttp://lattes.cnpq.br/9044234076308983pt_BR
dc.date.accessioned2024-07-05T18:17:39Z
dc.date.available2024-07-05T18:17:39Z
dc.date.issued2024-06-10
dc.description.abstractOpen-access molecular databases play a crucial role in the evolution of medicinal chemistry. However, the development of new drugs remains a challenge, especially for leishmaniasis, whether visceral or cutaneous. The limited efficacy and toxicity of existing treatments, along with the lack of interest from the pharmaceutical industry due to high costs and low financial returns, highlight the need for new research approaches for this neglected disease. In this context, the LeishMolDB project was developed as an accessible tool to facilitate the discovery of new compounds potentially active against the amastigote forms of Leishmania, allowing the assessment of their viability as future drugs. The selection process for the molecular structures began with a literature review of articles that included IC50 information against amastigotes, selecting the most active compounds. These molecules were designed, archived in tables, converted to 3D SDF format, and then optimized. The implementation of the web platform started with the development of the front-end using HTML, JavaScript, and Tailwind CSS. For the back-end, the Python programming language was employed, with an emphasis on the RDKit library, widely used in computational chemistry. The platform offers five intuitive interfaces that allow users to explore the stored molecules and associated molecular data, such as SMILE, molecular weight, log P, hydrogen bond donors and acceptors, and TPSA. Additionally, it allows the download of structures and ligand-based virtual screening using the Tanimoto coefficient. Thus, LeishMolDB stands out as an important tool, with manually verified 3D structures, aimed at collaborating with the scientific community in the development of new drugs. The continuous sharing of information and updates aims to reduce resources and costs associated with pharmaceutical research.pt_BR
dc.description.resumoOs bancos de dados moleculares de acesso livre desempenham um papel crucial na evolução da química medicinal. No entanto, o desenvolvimento de novos fármacos continua a ser um desafio, especialmente para a leishmaniose, seja visceral ou cutânea. A eficácia limitada e a toxicidade dos tratamentos existentes, juntamente com a falta de interesse da indústria farmacêutica devido aos altos custos e baixo retorno financeiro, ressaltam a necessidade de novas abordagens de pesquisa para essa doença negligenciada. Nesse contexto, o projeto LeishMolDB foi desenvolvido como uma ferramenta acessível para facilitar a descoberta de novos compostos potencialmente ativos contra as formas amastigotas de Leishmania, permitindo avaliar sua viabilidade como futuros fármacos. O processo de seleção das estruturas moleculares começou com um levantamento bibliográfico de artigos que incluíam informações de IC50 contra amastigotas, selecionando os compostos mais ativos. Essas moléculas foram desenhadas, arquivadas em tabelas, convertidas para o formato 3D .sdf e então otimizadas. A implementação da plataforma web começou com o desenvolvimento do front-end, utilizando HTML, JavaScript e Tailwind CSS. Para o back-end, foi empregada a linguagem de programação Python, destacando-se a biblioteca RDKit, amplamente usada na química computacional. A plataforma oferece cinco interfaces intuitivas que permitem aos usuários explorar as moléculas armazenadas e os dados moleculares associados, como SMILE, peso molecular, log P, doadores e aceptores de hidrogênio e TPSA. Além disso, permite o download das estruturas e a triagem virtual baseada em ligantes, utilizando o coeficiente de Tanimoto. Assim, o LeishMolDB se destaca como uma ferramenta importante, com estruturas 3D verificadas manualmente, destinada a colaborar com a comunidade científica no desenvolvimento de novos fármacos. O compartilhamento contínuo de informações e atualizações visa reduzir recursos e custos associados à pesquisa farmacêutica.pt_BR
dc.identifier.citationPINTO, Samara Beatriz de Abreu. Plataforma integrada para pesquisa e análise de compostos promissores para o tratamento da leishmaniose: LeishMolDB. Orientador: Euzébio Guimarães Barbosa. 2024. 33 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Farmácia) - Departamento de Farmácia, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, RN, 2024.pt_BR
dc.identifier.urihttps://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/58609
dc.languagept_BRpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal do Rio Grande do Nortept_BR
dc.publisher.countryBrasilpt_BR
dc.publisher.departmentFarmáciapt_BR
dc.publisher.initialsUFRNpt_BR
dc.publisher.programFarmáciapt_BR
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil*
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/*
dc.subjectLeishmaniosept_BR
dc.subjectQuímica Medicinalpt_BR
dc.subjectTriagem Virtualpt_BR
dc.subjectBancos de Dadospt_BR
dc.subjectDesenvolvimento de Fármacospt_BR
dc.subject.cnpqCNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::FARMACIApt_BR
dc.titlePlataforma integrada para pesquisa e análise de compostos promissores para o tratamento da leishmaniose: LeishMolDBpt_BR
dc.title.alternativeIntegrated platform for research and analysis of promising compounds for the treatment of leishmaniasis: LeishMolDBpt_BR
dc.typebachelorThesispt_BR

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