PPGGBM - Mestrado em Genética e Biologia Molecular

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Estrutura genética de populações de Amphobotrys ricini, agente causal do mofo cinzento da mamoneira
(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-22) Bezerra, Cintia de Sousa; Vidal, Márcia Soares; ; http://lattes.cnpq.br/3036544314910366; ; http://lattes.cnpq.br/5297087334987268; Suassuna, Nelson Dias; ; http://lattes.cnpq.br/4344026717541727; Molina, Wagner Franco; ; http://lattes.cnpq.br/8437464961129518
O mofo cinzento, causado pelo fungo Amphobotrys ricini, é um dos principais problemas fitossanitários da cultura mamoneira. Esta doença causa prejuízos a cultura podendo levar à perda total da produção caso medidas de controle não sejam implementadas a tempo. A determinação da estrutura genética de populações de patógenos e o monitoramento sistemático das populações com o intuito de compreender a dinâmica de seus aspectos genéticos é importante para que programas de melhoramento visando a resistência durável tenham êxito. O controle químico do patógeno também é necessário, entretanto, não existem fungicidas registrados para o controle da doença. O objetivo deste trabalho foi determinar a variabilidade genética entre e dentro de subpopulações de A. ricini no estado da Paraíba, empregando marcadores moleculares do tipo RAPD e analisar a sensibilidade de isolados de A. ricini aos fungicidas carbendazim e azoxistrobina. Para a determinação da estrutura genética foram analisados 23 isolados de duas subpopulações (SPs), sendo a SP1 formada por isolados coletados nos municípios de Campina Grande, Lagoa Seca e Esperança e a SP2 com isolados oriundos dos municípios de Areia, Remígio, Solânea e Alagoa Nova. Amostras de DNA purificadas dos isolados foram submetidas a reações RAPD com 22 oligonucleotídeos da série OPERON, gerando 80 fragmentos polimórficos que foram analisados pelo programa PopGene. Para verificar a sensibilidade a fungicidas, 30 isolados de duas populações, sendo uma da Paraíba e outra de Alagoas foram testados contra o Carbendazim avaliando-se o crescimento micelial em meio V8 acrescido do fungicida nas dosagens 0, 0.01, 0.1, 1, 10 e 100 µg/ml; e azoxistrobina avaliando-se a germinação de esporos. Os dados foram analisados pelo procedimento PROBIT do pacote estatístico SAS que calculou a dosagem necessária para inibir 50% do crescimento micelial (DL50). A diversidade genética total (Ht=0,293) é devida à diversidade genética dentro das SPs (Hs=0,271). O número de migrantes foi estimado em 6,15 indivíduos a cada geração entre as subpopulações. A fração da variação genética distribuída entre as subpopulações Gst foi 0,075. Houve baixa diferenciação entre as subpopulações com base na média de identidade genética (Nei, 1973) entre as subpopulações em todos os locos analisados (0,9468). Os valores de DL50 variaram entre 0,026 e 0,316 µg/ml para carbendazim e 0,0036 e 0,168 µg/ml para azoxistrobina. Neste estudo, há evidências de que a estrutura genética da população de A. ricini no estado da Paraíba seja clonal e que há intensa migração e que os isolados da Paraíba e Alagoas são sensíveis a carbendazim e azoxistrobina
Diversificação cariotípica em cinco espécies de moréias do Atlântico Ocidental (Anguilliformes)
(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-23) Vasconcelos, Antônio Jales Moraes; Molina, Wagner Franco; ; http://lattes.cnpq.br/8437464961129518; ; http://lattes.cnpq.br/8784507023640851; Affonso, Paulo Roberto Antunes de Mello; ; http://lattes.cnpq.br/4149576837587664; Panosso, Renata de Fátima; ; http://lattes.cnpq.br/2543467420133635
Os Anguiliformes são constituídos por 15 famílias, 141 gêneros e 737 espécies. Neste grupo oito famílias possuem pelo menos uma espécie cariotipada, onde é evidenciada uma prevalência de cariótipos com 2n=38 cromossomos e NF elevados, aparentemente basal para os Anguiliformes. A única família que exibe um padrão cariotípico diferente das demais é a família Muraenidae. Nesta, das oito espécies já descritas, todas apresentam 2n=42 cromossomos. Apesar da dimensão desta Ordem, poucas espécies apresentam descrições cariotípicas. No presente trabalho, uma espécie de Ophichthidae, Myrichthys ocellatus (2n=38; 8m+14sm+10st+6a; NF=70) e quatro espécies de Muraenidae, Enchelycore nigricans (2n=42; 6m+8sm+12st+16a; NF=68), Gymnothorax miliaris (2n=42; 14m+18sm+10st; NF=84), Gymnothorax vicinus (2n=42; 8m+6sm+28a; NF=56) e Muraena pavonina (2n=42; 6m+4sm+32a; NF=52), coletadas no litoral do Rio Grande do Norte, Arquipélago de São Pedro e São Paulo e litoral da Bahia, foram analisadas. Cromossomos mitóticos foram obtidos através de preparações de curto termo, precedidas por estimulação mitótica com levedura. Entre as espécies observa-se a presença de grandes pares cromossômicos metacêntricos (≅10µm) característicos. Quanto aos padrões estruturais nestas espécies foram evidenciadas regiões heterocromáticas em posição centromérica da maioria dos pares cromossômicos e sítios ribossomais simples. Para a família Ophichthidae, os dados obtidos corroboram a hipótese de diversificação cariotípica mediada pela ocorrência de inversões pericêntricas e rearranjos robertsonianos, enquanto que nos Muraenidae, a identificação de valores cromossômicos maiores (2n=42), sugere cariótipos mais derivados, possivelmente ocasionados por possíveis fissões cromossômicas
Caracterização da resistência do algodoeiro a Ramularia areola e variabilidade molecular do patógeno
(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-23) Lucena, Valeska Silva; Hoffmann, Lúcia Vieira; ; http://lattes.cnpq.br/1552220402943995; ; http://lattes.cnpq.br/4490260435452349; Suassuna, Nelson Dias; ; http://lattes.cnpq.br/4344026717541727; Giband, Marc; ; http://lattes.cnpq.br/0551184684899446
Este estudo teve como objetivos estudar a estrutura genética e patogênica de isolados de Ramularia areola do Brasil e caracterizar a resposta de resistência no algodoeiro à mancha-de-ramulária. Foi avaliada a variabilidade genética de 28 isolados do patógeno, utilizando-se marcadores RAPD. A avaliação da patogenicidade de 6 desses isolados foi realizada após a inoculação nas variedades Guazuncho-2 (Gossypium hirsutum) suscetível e VH8-4602 (Gossypium barbadense) resistente à doença. A herança da resistência no algodoeiro à doença foi caracterizada pela medição de intensidade da doença nas variedades Guazuncho-2 (G. hirsutum), suscetível, e VH8-4602 (G. barbadense), resistente à doença, e nas gerações F1 e F2 provenientes do cruzamento entre elas. O polimorfismo molecular entre as linhagens de G. hirsutum DeltaOpal e CNPA CO11612, contrastantes fenotipicamente quanto à resistência à doença foi avaliado utilizando-se 118 marcadores SSR e 24 AFLP. Para mapeamento molecular dos genes de resistência, linhagens recombinantes RIL s derivadas do cruzamento entre Guazuncho-2 e VH8-4602 foram genotipadas utilizando marcadores SSR. A análise da estrutura da população de R. areola revelou que as três subpopulações foram semelhantes geneticamente (Gst=0.18). Os isolados de Goiás e Minas Gerais obtiveram maior similaridade genética (0,92), que pode estar associada com o alto fluxo genético existente entre as subpopulações que foi de (Nm=2.20). Quanto à patogenicidade, os isolados de R. areola 9.1, coletado no estado de Minas Gerais, 8.2 e 8.3 de Goiás, foram mais agressivos na variedade suscetível Guazuncho-2. A variedade VH8-4602 apresentou alto nível de resistência à doença. Não foi observada interação diferencial entre os patógenos e as variedades analisadas, sendo a resistência classificada como horizontal. Na análise dos indivíduos das gerações F1 e F2, provenientes do cruzamento entre Guazuncho-2 e VH8-4602, a quantificação de sintomas da doença através da contagem de manchas necróticas e pelo número de esporos mostrou variação contínua da resistência à doença nos indivíduos da geração F2, indicando que a herança é poligênica. O aparecimento de sintomas e esporulação nos indivíduos F1 mostrou que a resistência é recessiva. O polimorfismo molecular entre as linhagens de G. hirsutum, DeltaOpal e CNPA CO11612 foi de 6%, portanto baixo, para realizar o mapeamento. Durante genotipagem das RIL´s foi verificado que 25% dos marcadores segregaram de acordo com as proporções das leis de Mendel, e 75% desses marcadores apresentaram distorção de segregação, com aumento da proporção de genes do parental G. hirsutum. A baixa variabilidade do patógeno e número de genes de resistência sugere que a resistência genética ao patógeno tenha alta durabilidade
Análise molecular dos éxons 8 a 11 do gene da p53 em amostras de câncer de colo de útero no Rio Grande do Norte
(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-23) Barbosa, Rodrigo Niskier Ferreira; Meissner, Rosely de Vasconcellos; ; http://lattes.cnpq.br/7518973237001429; ; http://lattes.cnpq.br/7870682050323416; Rabenhorst, Silvia Helena Baren; ; http://lattes.cnpq.br/3868264006150535; Fernandes, José Veríssimo; ; http://lattes.cnpq.br/7078820975978056; Blaha, Carlos Alfredo Galindo; ; http://lattes.cnpq.br/2307806644081146
As mutações no TP53 são frequentes nos cânceres humanos, mas não no câncer do colo do útero onde são raramente detectadas e a inativação e degradação da p53 é atribuída à ação do oncogene viral E6 dos papilomavírus humanos (HPVs) de alto risco. A partir da análise de linhagens celulares de carcinoma cervical foi sugerido que carcinomas cervicais HPV negativos apresentavam mutações no TP53, mas a análise de amostras clínicas não confirmou esta hipótese. Entretanto, na maioria dos estudos de mutações do TP53 no câncer de colo do útero foram analisados principalmente os éxons 5 a 8, região onde estão localizadas cerca de 90% das mutações descritas neste gene. Estudos recentes em diferentes tipos de câncer sugerem que a freqüência de mutações nos demais éxons do TP53 não é desprezível. O objetivo deste trabalho foi verificar se ocorrem mutações em regiões codificantes e não codificantes do TP53 humano em amostras de tecido de câncer de colo do útero de pacientes no Rio Grande do Norte utilizando eletroforese em gel com gradiente de desnaturação (DGGE) como técnica de triagem. Foram analisados os exons 8 a 11, incluindo alguns introns, de 80 amostras de tumor e 8 amostras de sangue periférico de mulheres saudáveis. O DNA obtido das amostras foi amplificado por PCR usando iniciadores com grampo GC na extremidade de um deles. Os resultados para cada região foram visualizados após DGGE e coloração por nitrato de prata. Não foram observadas bandas amplificadas com padrão de migração diferente das obtidas de DNA de sangue periférico. Estes resultados estão de acordo com os descritos na literatura onde mutações no TP53 no câncer do colo do útero têm sido descritas com freqüência muito baixa
Caracterização dos genes scMUTM1 e scMUTM2 de cana-de-açúcar
(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-23) Medeiros, Viviane Katielly Silva; Scortecci, Kátia Castanho; ; http://lattes.cnpq.br/4808910380593455; ; http://lattes.cnpq.br/0635169659175207; Lima, Lucymara Fassarela Agnez; ; http://lattes.cnpq.br/1083882171718362; Machado, Carlos Renato; ; http://lattes.cnpq.br/6306925202374274
As plantas são organismos particularmente susceptíveis aos efeitos genotóxicos devido a sua constante exposição a agentes do meio ambiente tais como a luz [incluindo a ultravioleta (UV)], o calor, a seca e diferentes substâncias químicas. Entretanto, existem diferentes mecanismos de reparo para detectar estas lesões e corrigi-las. Entretanto, em plantas estas vias são pouco compreendidas. Uma das vias é a por excisão de bases (BER). A proteína MUTM/FPG é uma DNA glicosilase da via BER que corrige danos oxidativos. No genoma da cana-de-açúcar foram encontrados dois possíveis cDNAs que possuem homologia de seqüência a esta proteína: scMUTM1 e scMUTM2. O objetivo deste trabalho foi caracterizar o papel destes genes em plantas. Para isto, o nível de expressão dos genes após estresse oxidativo foi avaliado através de RT-PCR semiquantitativo. Para obter a sequência completa dos gene, uma biblioteca de DNA genômico de cana-de-açúcar foi hibridizada com sondas radioativas para ambos cDNAs, encontrando-se dois clones em potencial. A região promotora foi clonada, seqüenciada e analisada. Dentro das seqüências obtidas para a região promotora de scMUTM2, estas podem ser divididas em seis grupos. Os motivos regulatórios foram identificados, tais como o TATA-box, CAAT-box, elementos de resposta ao estresse oxidativo e elementos de resposta à luz. Um outro ponto de interesse neste trabalho foi a caracterização da região N-terminal da proteína scMUTM1. Para isto, foram realizadas algumas construções via PCR. Estas construções foram posteriormente introduzidas em cepas selvagem (CC104) e duplo mutante (CC104mutMmutY) de Escherichia coli e foram realizados ensaios de complementação de modo a avaliar a importância de cada região para o reconhecimento e correção das lesões. Os resultados mostraram que as proteínas com deleções na porção N-terminal de scMUTM1 são capazes de complementar a deficiência de Fpg and MutY-glicosilase na bactéria CC104 mutMmutY reduzindo assim a freqüência de mutação espontânea
Desenvolvimento de sistemas farmacêuticos emulsionados para veiculação gênica
(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-26) Veríssimo, Lourena Mafra; Egito, Eryvaldo Sócrates Tabosa do; Lima, Lucymara Fassarela Agnez; ; http://lattes.cnpq.br/1083882171718362; ; http://lattes.cnpq.br/6907806915889763; ; http://lattes.cnpq.br/9173400981540256; Magalhães, Nereide Stella Santos; ; Medeiros, Sílvia Regina Batistuzzo de; ; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781004Y8
Terapia gênica, em uma ampla definição, é o tratamento de doenças baseado na transferência de material genético a uma célula, tecido ou órgão com o intuito de curar ou melhorar o estado clínico do paciente. Em sua forma mais simples, a terapia gênica consiste na inserção de genes funcionais em células com genes defeituosos objetivando substituir, complementar ou inibir esses genes causadores de doenças. Para que o DNA exógeno seja expresso em uma população celular faz-se necessária a sua transferência até o local. Assim, é necessário criar veículos, os vetores, que transportem e protejam o DNA até que este chegue a uma população celular alvo. Os obstáculos encontrados com a utilização de vetores virais têm proporcionado o interesse no desenvolvimento de emulsões catiônicas como vetores não-virais, por serem fáceis de produzir, apresentarem estabilidade controlável e facilitarem a transfecção gênica. O objetivo deste trabalho foi desenvolver um sistema emulsionado para terapia gênica e avaliar sua capacidade de compactação de ácidos nucléicos através da sua associação com o plasmídeo pIRES2-EGFP. Primeiramente o EHLc do TCM utilizado, o Captex® 355, foi determinado através de ensaios de estabilidade acelerada e a longo termo. Com base nos resultados obtidos, emulsões de EHL 10,7 compostas de Captex® 355, Tween 20® e Span 60® foram preparadas pelos métodos de inversão de fases, emulsificação espontânea e sonicação e elegeu-se o melhor método para o preparo das emulsões catiônicas. As emulsões de menor granulometria e maior estabilidade foram obtidas através do método de sonicação. As emulsões catiônicas foram preparadas acrescendo-se à emulsão base o DOTAP e a sua associação com o pIRES2-EGFP foi avaliada através da técnica de eletroforese em gel de agarose. Várias proporções de emulsão e DNA foram testadas e os resultados demonstraram que houve formação de 100% dos complexos quando a proporção DOTAP/DNA(nmol/µg) foi igual a 130. Em conclusão, o conjunto dos resultados obtidos demonstra a capacidade da emulsão proposta neste trabalho de compactar o DNA, requisito necessário para uma boa transfecção, tornando a formulação uma forte candidata à utilização em terapia gênica
Padrões cariotípicos em tetraodontiformes (Osteichthypes) :redução genômica e mecanismos de diversificação
(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-26) Lima, Lorena Corina Bezerra de; Molina, Wagner Franco; ; http://lattes.cnpq.br/8437464961129518; ; http://lattes.cnpq.br/1493167465165613; Fernandes, José Veríssimo; ; http://lattes.cnpq.br/7078820975978056; Affonso, Paulo Roberto Antunes de Mello; ; http://lattes.cnpq.br/4149576837587664
RESUMO A ordem Tetraodontiformes é composta por cerca de 400 espécies de peixes, distribuídas em dez famílias, com distribuição circuntropical. A diversidade morfológica de cada família reflete em, parte, os diferentes níveis de especialização. Este grupo representa uma linhagem pós-Perciformes e constitui o último ramo da difusão dos Teleósteos, ocupando uma posição filogenética de destaque. Nesta ordem encontram-se algumas das espécies de peixes mais conhecidas popularmente, os baiacus, famílias Diodontidae e Tetraodontidae; e os cangulos, famílias Balistidae e Monacanthidae. Existem diversos trabalhos examinando as relações filogenéticas dos Tetraodontiformes e, em todos, estas famílias são reconhecidas como grupos irmãos, sendo Diodontidae mais próximo de Tetraodontidae e Balistidae mais próximo de Monacanthidae. Embora possua um número representativo de espécies, são poucos os trabalhos citogenéticos envolvendo exemplares das famílias Balistidae e Monacanthidae, especialmente espécies insulares. Neste trabalho foram analisadas citogeneticamente as espécies Cantherhines macrocerus, Cantherhines pullus (Monacanthidae), Melichthys niger (Balistidae), Sphoeroides testudineus (Tetraodontidae) e Chilomycterus antennatus (Diodontidae); através de coloração convencional, Ag-RONs e bandamento C. Diante das diferentes tendências de evolução cariotípicas apresentadas pelos Tetraodontiformes, o presente trabalho também buscou verificar a existência de relação entre o tamanho total dos cromossomos com a quantidade de DNA nestes grupos de Tetraodontiformes. Para tal, foram correlacionados o tamanho total do complemento haplóide destas espécies, com valores de conteúdo de DNA disponíveis na literatura. As análises citogenéticas para as espécies C.macrocerus, C.pullus (Monacanthidae) e M.niger (Balistidae), revelaram um cariótipo composto de 40 cromossomos, todos acrocêntricos. Todas possuem apenas um par de RONs e heterocromatina pericentromérica. Para S.testudineus o número diplóide encontrado foi igual a 2n=46, com NF=78 (16m+18sm+8st+4a), enquanto que para C.antennatus possui 2n=50, com NF=76 (4m+22st+24a). Ambas espécies possuem RONs simples e blocos heterocromáticos centroméricos. Em M. niger, a presença de marcação positiva (heterocromatina e RON) na constrição secundária no 2°par cromossômico em M. niger sugerindo a ocorrência de um rearranjo, possivelmente uma fusão envolvendo estes homólogos, indicando que estes eventos foram importantes para o estabelecimento dos cariótipos deste grupo.A manutenção da constância cariotípica encontrada nas populações de C. macrocerus (Monacanthidae) e Sphoeroides testudineus (Tetraodontidae) talvez se deva pelo favorecimento do fluxo gênico através das correntes oceânicas. Estes dados contrastam com os citótipos diferenciados de C.antennatus entre a costa Nordeste e Sudeste, sugerindo que os padrões ecológicos de cada espécie, somados às condições do meio ambiente marinho, possam ser responsáveis pela delineação cariotíopica de cada espécie. As características citogenéticas encontradas para as espécies C.macrocerus, C.pullus, M.niger, S.testudineus e C.antennatus somam-se aos dados disponíveis para outras espécies de Tetraodontiformes. A partir dos dados obtidos no presente estudo, pode-se inferir que o conteúdo de DNA possui relação direta com o comprimento total do genoma
Caracterização genética e in situ de Gossypium barbadense na região norte do Brasil
(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-27) Almeida, Vanessa Cavalcante de; Barroso, Paulo Augusto Vianna; ; http://lattes.cnpq.br/2493954146850909; ; http://lattes.cnpq.br/0012158715722566; Silva Filho, João Luis da; ; http://lattes.cnpq.br/0608088933335198; Macedo, Cristiane Elizabeth Costa de; ; http://lattes.cnpq.br/8290207282547590
O Brasil é considerado um dos centros de diversidade da espécie Gossypium barbadense. Acredita-se que grande parte da variabilidade genética de G. barbadense esteja sendo perdida, em virtude de problemas econômicos, culturais e agrícolas. O primeiro passo para reduzir a perda de diversidade e estabelecer estratégias de conservação in situ é realizar um diagnóstico de como a espécie se encontra nos locais em que ocorre. Os objetivos deste trabalho foram identificar populações de Gossypium presentes no estado do Pará e Amapá, caracterizá-Ias, determinar os principais riscos e coletar acessos para armazenamento em bancos de germoplasma. Foram realizadas expedições em Novembro de 2004, e a caracterização in situ de G. barbadense foi realizada por entrevista do proprietário da planta e da análise do ambiente em que as plantas estavam inseridas. Foram coletadas 179 plantas em 22 municípios no estado do Pará e 117 plantas em nove municípios no estado do Amapá. A maioria das plantas pertence à espécie G. barbadense (98% no Amapá e 94% no Pará). As plantas ocorrem em fundo de quintal, beira de estrada e de modo espontâneo, sendo as de fundo de quintal bem mais abundantes (97% no Amapá e 95% no Pará) e mantidas com a finalidade principal de serem usadas como plantas medicinais. Os moradores não possuem o hábito de armazenar e beneficiar as sementes, no Pará apenas 1 % dos proprietários relatou armazenar as sementes e no Amapá esse índice foi de 11 %. A maioria das plantas coletadas tinha de dois a três anos de idade (58% no Amapá e 93% no Pará). Conclui-se então que G. barbadense é a espécie mais difundida nos dois estados e que são encontradas em fundo de quintal. No estado do Amapá predomina a variedade botânica barbadense ou Quebradinho, enquanto que no Pará predomina a variedade brasiliense ou Rim-de-boi. Não foram encontradas plantas em ambientes naturais nos dois estados, portanto a criação de reservase o emprego de outros métodos convencionais de manutenção in situ não parecem ser aplicáveis a G. barbadense em ambos os estados. A adequada conservação dessas espécies deve ser realizada em coleções de germoplasma mantidas ex situ
Levantamento cariotípico em espécies de peixes marinhos costeiros de fundo arenoso (Osteichthypes, Perciformes)
(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-27) Accioly, Ingrid Vilar; Molina, Wagner Franco; ; http://lattes.cnpq.br/8437464961129518; ; http://lattes.cnpq.br/9890715324172958; Affonso, Paulo Roberto Antunes de Mello; ; http://lattes.cnpq.br/4149576837587664; Blaha, Carlos Alfredo Galindo; ; http://lattes.cnpq.br/2307806644081146
Análises citogenéticas em peixes são importantes porque os mesmos compõem um grupo particular entre os vertebrados, ocupando posição central na evolução animal. A Ordem Perciformes, dominante nos ambientes marinhos e dulcícolas, constitui um modelo potencialmente útil na avaliação genética de populações, como também no entendimento de seus processos evolutivos. Apesar disto, ainda são escassos os estudos citogenéticos neste grande grupo, sobretudo para os habitantes de fundo arenoso e hábitos pelágicos. O presente trabalho se propôs a contribuir para a caracterização citogenética de nove espécies de peixes marinhos litorâneos de fundo arenoso do litoral do Rio Grande do Norte (Brasil), identificando os padrões evolutivos relacionados ao cariótipo nestas espécies e a existência de afinidades filogenéticas entre elas e outros Perciformes. Os animais foram coletados nas praias da Redinha, Ponta Negra e Búzios (Litoral do Rio Grande do Norte) e no Arquipélago de São Pedro e São Paulo. Posteriormente foram submetidos às técnicas citogenéticas que consistem em estimulação mitótica, obtenção de cromossomos mitóticos, seguida por técnicas de coloração convencional (Giemsa) e bandamentos cromossômicos (Ag-RONs e bandamento C). Número diplóide e número fundamental iguais a 48 foram observados na maioria das espécies: Menticirrhus americanus, Ophioscion punctatissimus, Pareques acuminatus (Sciaenidae); Chloroscombrus chrysurus (Carangidae); Echeneis sp. 2 (Echeneidae); Archosargus probatocephalus (Sparidae) e Orthopristis ruber (Haemulidae). Trachinotus goodei (NF=52) (Carangidae) e Echeneis sp. 1 (Echeneidae) (NF=54) apresentaram uma variação no NF, mantendo-se constante um número diplóide igual a 48. As RONs estavam situadas em posição pericentromérica em todas os scianídeos, e nas espécies Echeneis sp. 2 (22° par), O. ruber e A. probatocephalus (1° par), coincidindo com grandes blocos heterocromáticos em M. americanus (1° par), P. acuminatus (2° par) e O. ruber (1° par). As RONs também foram localizadas na região telomérica do braço curto do 5° e 11° pares acrocêntricos em T. goodei, 4° e 19° pares de C. chrysurus, 1° par (sm) de Echeneis sp. 1. O bandamento C detectou blocos centroméricos na maioria dos cromossomos das espécies de Sciaenidae, Carangidae e Echeneidae, com grandes blocos em A. probatocephalus (4° par). Blocos heterocromáticos em regiões teloméricas em submetacêntricos de Echeneis sp. 1, e pericentroméricas em M. americanus (1° e 8° pares), O. punctatissimus (1° par) e P. acuminatus (2° par) também foram observados. Nota-se um marcante conservadorismo cromossômico nas espécies da família Scianidae e Haemulidae no que diz respeito ao número de cromossomos acrocêntricos e a localização das RONs. Porém é destacada a presença de eventos de heterocromatinização durante a evolução cariotípica desta família. Já nas famílias Sparidae e Carangidae, os resultados obtidos reafirmam exemplos de pequenas variações estruturais resultantes de inversões e translocações Robertsonianas, como principais mecanismos de diversificação cariotípica, bem como um padrão evolutivo mais conservado numericamente, também observado em representantes de Echeneidae do Atlântico em relação ao Pacífico. A presença de RONs múltiplas, observadas nas espécies T. goodei e C. chrysurus parecem representar um caráter derivado na família Carangidae. Os resultados para as espécies O. ruber e A. probatocephalus sugerem a presença de possíveis barreiras geográficas ou climáticas entre suas populações no NE do Brasil, quando comparada com a região SE
Prospecção e caracterização de genes associados ao processo de indução floral em cana-de-açúcar
(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-28) Furtado, Cristiane Miranda; Scortecci, Kátia Castanho; ; http://lattes.cnpq.br/4808910380593455; ; http://lattes.cnpq.br/8733809210008076; Vidal, Márcia Soares; ; http://lattes.cnpq.br/3036544314910366; Grangeiro, Thalles Barbosa; ; http://lattes.cnpq.br/3114375474778667
A região nordeste é responsável por 14,32% da produção nacional de cana-de-açúcar. Esta contribuição reduzida é devido às condições edafo-climáticas da região. A floração é um processo vital para a planta que consome muita energia e culmina num fenômeno denominado de isoporização do colmo. Esta isoporização pode acarretar numa redução de até 60% na produção de álcool e açúcar. Considerando que a cana-de-açúcar cultivada corresponde a um híbrido com o genoma octaploide, existem variedades com um padrão de florescimento precoce até um padrão de não florescimento. Utilizando este potencial genético natural presente nas diferentes cultivares de cana-de-açúcar na região nordeste, o objetivo do presente trabalho foi de compreender como ocorre esse processo de floração por meio da metodologia de bibliotecas subtrativas. O RNA total foi extraído utilizando o reagente Trizol (Invitrogen) de ápices meristemáticos de cultivares com florescimento precoce induzida e não induzida e outra com florescimento tardio. A partir deste RNA total foram construídas as quatro bibliotecas subtrativas (B1 florescimento precoce induzida subtraída da tardia não-induzida; B2 florescimento tardio não-induzida subtraído da precoce induzida; B3 precoce induzida subtraída da precoce não-induzida; B02 precoce não-induzida subtraída da precoce induzida), utilizando os kits Super Smart cDNA syntesis e o kit BD Clontech PCR select cDNA subtraction (Clontech). Este material foi clonado no vetor pGEM T-easy (Promega) e transformados em células competentes de E. coli DH10B. A análise das seqüências obtidas foi realizada utilizando o programa BLASTn contra o banco de dados do NCBI e do genoma de Arabidopsis thaliana, arroz e milho. Os clones foram agrupados em 9 diferentes classes de acordo com a função. Alguns fatores de transcrição já relatados como participantes da via de indução floral foram identificados nas diferentes bibliotecas. Além disso, proteínas associadas com o ciclo celular e seu controle também estavam presentes, destacando-se nesse grupo as proteínas quinases. Fatores relacionados à síntese protéica, metabolismo, defesa, transporte e comunicação celular, também foram obtidos em ambas bibliotecas. Alguns genes identificados nas bibliotecas não apresentaram similaridade nos bancos de dados ou apresentaram homologia com genes de função hipotética, e podem representar novos genes a serem depositados em bancos de dados internacionais. Estes resultados sugerem que alguns dos genes identificados em cana-de-açúcar, classificados tanto na classe de fatores de transcrição, ciclo celular e comunicação celular, além dos genes não conhecidos, possam estar associados com a variabilidade genética para o processo de floração encontrada na região nordeste
Avaliação da genotoxicidade das águas do lençol freático sob a Universidade Federal do Rio Grande do Norte
(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-28) Oliveira, Givanilson Brito de; Lima, Lucymara Fassarela Agnez; ; http://lattes.cnpq.br/1083882171718362; ; http://lattes.cnpq.br/4438490047829028; Medeiros, Sílvia Regina Batistuzzo de; ; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781004Y8; Lemos, Clarice Torres de; ; http://lattes.cnpq.br/5348706405357207
As águas subterrâneas representam o suprimento mais importante de água doce do planeta. Diariamente, em todo planeta, uma grande quantidade de material tóxico e genotóxico atingem os sistemas aquáticos, principalmente os aqüíferos. O aqüífero Barreiras, através de cinco poços, é responsável pelo abastecimento da Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN). Todos os poços encontram-se contaminados com nitrato e alguns metais pesados. Dois deles foram desativados. A genotoxicidade das amostras das águas subterrâneas do aqüífero Barreiras na UFRN foi avaliada usando os teste Allium cepa, o teste de Ames e o teste de microsuspensão com Salmonella typhimurium (Teste de kado). Para o teste Allium cepa a influência das amostras de água subterrâneas coletadas nos parâmetros macroscópicos (crescimento, coloração e forma da raiz), microscópico (índice mitótico, aberrações cromossômicas e micronúcleo) foram examinadas. Todas as amostras de água causaram aumento significante na freqüência de aberrações cromossômicas e mitóticas e redução no crescimento das raízes comparando com o controle negativo. Pontes e cromossomos stickness foram os tipos de aberrações mais freqüentes nas células em divisão. Além disso, quebras de DNA também foram observadas. Não foi encontrado aumento significante no número de micronúcleos comparando com o controle negativo. Para execução do teste de Ames, aplicando o método direto foram usadas às linhagens de Salmonella typhymurium TA98 e TA100 sem ativação metabólica. As amostras de água foram submetidas ao processo de concentração em resina XAD antes do teste de Kado. Extração orgânica foi realizada em colunas contendo resina XAD4 que absorve uma grande classe de compostos mutagênicos. A mutagenicidade dos extratos orgânicos foi avaliada pelo teste de Kado usando as linhagens TA98 e TA100, na ausência e na presença da fração S9 (ativação metabólica). As concentrações de sete metais pesados foram medidas nas amostras de água, apenas os níveis de Ni, Cu e Cr excederam os níveis máximos de concentrações permitidas para os reservatórios naturais. Os resultados obtidos para a atividade mutagênica usando o teste de Ames foi negativo em todas amostras de água bruta analisadas. Resultados positivos com o extrato da resina XAD4 das amostras de água foram obtidos para cepa TA98 na presença da fração S9 para duas amostras. Metais pesados e nitrato podem estar correlacionadas com a toxicidade e genotoxicidade observada nas amostras de água analisadas. O efeito mutagênico detectado com a linhagem TA98 sugere que compostos orgânicos (depois de metabolizados) causaram a mutagenicidade detectada nas amostras analisadas. Em conjunto, os dados obtidos neste trabalho indicam a presença de pelo menos duas classes de mutágenos: compostos orgânicos e inorgânicos
Avaliação da genotoxicidade das águas sueprficiais da Barragem Engenheiro Armando Ribeiro Gonçalves, Assu/RN
(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-28) Cabral, Thiago de Melo; Medeiros, Sílvia Regina Batistuzzo de; Panosso, Renata de Fátima; ; http://lattes.cnpq.br/2543467420133635; ; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781004Y8; ; http://lattes.cnpq.br/1599632696789745; Hacon, Sandra de Souza; ; http://lattes.cnpq.br/7653379361147439; Lima, Lucymara Fassarela Agnez; ; http://lattes.cnpq.br/1083882171718362
A contaminação de reservatórios de água é um dos principais problemas da atualidade. A Barragem Engenheiro Armando Ribeiro Gonçalves (EARG), (06º08 S; 37º07 W) localizada no estado do Rio Grande do Norte, é a segunda maior barragem do nordeste brasileiro, responsável pelo abastecimento doméstico de aproximadamente 415 mil habitantes do semi-árido brasileiro. A água da EARG é captada por um sistema de adutoras, onde é tratada e distribuída para a população. O presente trabalho teve o objetivo de avaliar o potencial genotóxico da água da Barragem EARG. Para isso, foram realizados os testes cometa e micronúcleo com eritrócitos de tilápias (Oreochromis niloticus) capturadas nesse reservatório. Os testes Allium cepa e mutação reversa com Salmonela typhimurium foram realizados com água do reservatório antes e após o tratamento. Além disso, análises quantitativa e qualitativa de cianobactérias, assim como a quantificação das microcistinas produzidas pelas cianobactérias presentes nesse reservatório foram realizados, apenas com amostras coletadas na barragem. Os resultados obtidos indicaram aumento significativo na freqüência de micronúcleos em eritrócitos de O. niloticus (p<0,05). A média obtida foi de 2,38 ± 3,02 micronúcleos em mil células analisadas, enquanto que o controle negativo apresentou média de 0,20 ± 0,41 micronúcleos. O ensaio cometa realizado com peixes da EARG foi analisado em uma escala crescente de danos (0 - 4), e mostrou resultados classificados nos níveis 0, 1, 2 e 3, enquanto que o controle negativo apresentou resultados nos níveis 0 e 1. Nos parâmetros macroscópicos avaliados no teste A. cepa não foi verificado alterações estatisticamente significativas. Os parâmetros microscópicos indicaram diminuição significativa no índice mitótico nos dois pontos estudados. Além disso, também foi detectado aumento na freqüência de metáfases e anáfases aberrantes em ambos os pontos, porém estatisticamente significativo apenas na amostra sem tratamento para anáfases aberrantes. A freqüência de micronúcleos no teste A. cepa não foi significativo em relação ao controle negativo. Para o teste de mutação reversa com S. typhimurium realizado com água sem extração, os resultados não demonstraram mutagenicidade para ambos os pontos. Os resultados encontrados com os extratos das amostras coletadas em ambos os pontos apresentaram diferenças estatisticamente significativa quando foi utilizada a fração S9 como ativador metabólico. Para a água não tratada, essas diferenças foram encontradas apenas para a cepa TA98, enquanto que para a água tratada, as duas linhagens apresentaram diferenças significativas. A análise qualitativa de cianobactérias demonstrou a existência de cianobactérias potencialmente tóxicas tais como Planktothrix agardii, Cylindrospermopsis raciborskii e Microcystis panniformes. O ensaio de HPLC indicou a presença de 38,1 μg/L de microcistinas na água da EARG. O teste de mutação reversa realizado com o extrato contendo microcistinas, não apresentou aumento na razão de mutagenicidade para TA100. O conjunto dos resultados obtidos no presente trabalho sugere que as águas da Barragem EARG podem conter agentes genotóxicos, capazes de alterar a informação genética dos indivíduos. Esses resultados indicam a necessidade de um programa de monitoramento e controle desses poluentes
Qualidade fisiológica de sementes de genótipos de algodoeiro sob estresse salino
(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-28) Lima, Leonardo Henrique Guedes de Morais; Vidal, Márcia Soares; Lima, Marleide Magalhães de Andrade; ; http://lattes.cnpq.br/1171370761724298; ; http://lattes.cnpq.br/3036544314910366; ; http://lattes.cnpq.br/9250206525235408; Fernandes, Pedro Dantas; ; http://lattes.cnpq.br/4411670211010251; Scortecci, Kátia Castanho; ; http://lattes.cnpq.br/4808910380593455
A germinação de sementes de algodão e a emergência de plântulas são geralmente retardadas e reduzidas pela salinidade. Embora o algodão seja considerado uma cultura tolerante, pode sofrer reduções substanciais no seu crescimento e na produção quando exposta à condição de salinidade. O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito do estresse salino na fase de germinação em quatro genótipos de algodão (BRS Rubi, BRS Safira, BRS 201 e CNPA 187 8H), empregando-se diferentes potenciais osmóticos, gerados com acréscimo de cloreto de sódio (NaCl). O estresse salino foi simulado, utilizando-se soluções aquosas de NaCl nos potenciais 0,0; -0,2; -0,4; -0,6; -0,8 e -1,0 MPa. Os tratamentos foram monitorados por meio de testes para análise de sementes: germinação, primeira contagem, índice de velocidade de germinação (IVG), comprimento de parte aérea, comprimento de radícula, peso seco de eixo embrionário e relação radícula/parte aérea. Os testes para germinação, primeira contagem e IVG foram realizados utilizando-se 50 sementes por repetição; para o estudo de comprimento de parte aérea, comprimento de radícula, peso seco de eixo embrionário e relação radícula/parte aérea, foram utilizadas 20 sementes por repetição. Para ambos os testes, foram realizadas quatro repetições por genótipo para cada um dos potenciais. As sementes de cada repetição foram envolvidas em papéis Germitest umedecidos com a solução de NaCl correspondente ao potencial. As repetições de ambos os testes foram conduzidas em germinador e a umidade mantida ao ponto de saturação. As leituras das três primeiras variáveis analisadas foram iniciadas quatro dias após a indução do estresse salino. As avaliações foram realizadas diariamente; as sementes foram retiradas e contabilizadas à medida que ocorria a germinação. Para os testes de comprimento, apenas as repetições correspondentes ao potencial de NaCl 0,0 MPa foram lidas, quatro dias após o início da indução do estresse. As leituras das repetições dos potenciais -0,2 e -0,4 e dos potenciais -0,6, -0,8 e -1,0 MPa foram realizadas, respectivamente, aos 12º e 20º dias. Para a realização das leituras deste teste, a parte aérea das 20 plantas de cada repetição foi separada da radícula e ambas mensuradas. As análises estatísticas foram efetuadas, utilizando-se os procedimentos GENMOD e GLM do SAS. Para a variável germinação, as cultivares CNPA 187 8H e BRS Safira destacaram-se para o potencial -0,8 MPa, com médias de 89% e 81%, respectivamente. Foi observado que o aumento do potencial salino reduziu a porcentagem do IVG. Para cada dia de avaliação, verificou-se que o aumento do potencial salino provoca uma redução do comprimento da parte aérea e da radícula. A radícula tende a crescer mais que a parte aérea até o potencial -0,4 MPa
Estudos in silico da proteína AlkB e prospecção de bactérias alcanotróficas em solos da bacia petrolífera potiguar
(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-28) Pereira, Matheus Silva; Blaha, Carlos Alfredo Galindo; ; http://lattes.cnpq.br/2307806644081146; ; http://lattes.cnpq.br/4843315104775965; Araújo, Magnólia Fernandes Florêncio de; ; http://lattes.cnpq.br/4511989641459455; Oliveira, Valéria Maia de; ; http://lattes.cnpq.br/3886687872358496
Alguns microrganismos de ecossistemas virgens são capazes de utilizar petróleo como fonte de carbono e energia. O conhecimento dessa biodiversidade microbiana pode revelar vias metabólicas microbianas para utilizar alcanos que venham a ter importância biotecnológica. Os objetivos do presente trabalho são: i) realizar estudos in silico da proteína AlkB visando obter subsídios para a compreensão do mecanismo de seletividade na utilização de alcanos em bactérias Gram positivas e Gram negativas; ii) prospectar e avaliar a resposta de comunidades microbianas alcanotróficas de solos e mangue da BPP RN e solo da Mata Atlântica na Reserva Horto Dois Irmãos-PE utilizando o gene alkB como biomarcador molecular, e as técnicas de PCR e PCR-DGGE
Prospecção de genes associados ao processo de floração em tomateiro
(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2008-02-28) Ferreira, Daiane Cristina Cabral; Scortecci, Kátia Castanho; http://lattes.cnpq.br/4808910380593455; http://lattes.cnpq.br/0972767522303368; Peres, Lazaro Eustáquio Pereira; http://lattes.cnpq.br/5548804788102914; Uchoa, Adriana Ferreira; http://lattes.cnpq.br/6644671747055211
A floração é controlada por condições ambientais e fatores endógenos que se associam numa rede de mecanismos genéticos bastante complexos. Análises de genes chaves da floração foram feitas primariamente em Arabidopsis thaliana tem fornecido grande conhecimento sobre mecanismos genéticos que controlam diferentes aspectos do desenvolvimento floral. Existem muitos homólogos descritos em diversas outras espécies, inclusive em plantas de interesse agronômico como o tomateiro. Nesta planta, as variações genéticas naturais relacionadas com a floração podem ter origem em diferentes genes expressos durante o desenvolvimento. Com isso, o objetivo deste trabalho foi de prospectar genes associados ao processo de floração utilizando a variação genética natural existente entre L. esculentum cv Micro-tom e L. pimpinellifolium, aplicando-se a metodologia de biblioteca subtrativa e análise de expressão por qPCR em tempo real. Os resultados obtidos permitiram uma identificação de alguns genes que possam ser associados à floração nestas espécies. Foram encontrados nas bibliotecas subtrativas genes relacionados tanto com o desenvolvimento vegetativo quanto genes ligados ao desenvolvimento reprodutivo, além de muitos genes não identificados em bancos de dados. Foram analisadas as expressões de três genes por qPCR. As análises sugerem uma provável associação do gene da histona H2A com a floração em L. pimpinellifolium, além de ter sido identificado também um gene desconhecido que pode ser outro fator chave na transição do meristema floral nessa espécie. Para os dados de expressão do gene fator de elongação 1-α, outro gene resultante da subtração de uma biblioteca com mensagens vegetativas, não foi encontrada ligação com a floração. Visando-se melhor caracterizar este evento fisiológico em tomateiro, devem-se realizar estas análises para os outros genes identificados.
Análise da genotoxicidade das águas da Lagoa da Extremoz - RN
(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2008-03-10) Barbosa, Jefferson da Silva; Medeiros, Sílvia Regina Batistuzzo de; ; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781004Y8; ; http://lattes.cnpq.br/9541087915767681; Morales, Maria Aparecida Marin; ; http://lattes.cnpq.br/6712127307223557; Lima, Lucymara Fassarela Agnez; ; http://lattes.cnpq.br/1083882171718362
A contaminação dos recursos hídricos, por efluentes de origem doméstica e industrial, é um sério problema ambiental, que compromete o uso de suas águas tanto para o consumo humano quanto para a agricultura. A Lagoa de Extremoz-RN é uma importante fonte de água para o abastecimento da cidade do Natal, suprindo uma população de aproximadamente 160.000 habitantes. Esse corpo aquático está localizado próximo a um pólo industrial o qual pode ser um fator de risco a qualidade de suas águas. O presente estudo teve como objetivo analisar o potencial genotóxico das águas da lagoa de Extremoz entre os meses de setembro de 2006 e janeiro de 2008, pelo uso combinado do teste Allium cepa, teste micronúcleo e ensaio cometa em eritrócitos do sangue periférico de Oreochromis niloticus. Adicionalmente foram quantificados os níveis de sete diferentes metais pesados pela da técnica de espectrometria de absorção atômica de chama. O teste A. cepa não detectou aumento nas freqüências de micronúcleos em nenhum dos períodos analisados, porém um forte efeito citotóxico, demonstrado pela diminuição no índice mitótico, foi observado nas análises realizadas em abril e julho de 2007. Resultados negativos também foram encontrados nas freqüências de micronúcleos em O. niloticus. Uma alteração estatisticamente significativa foi observada nos níveis de quebra no DNA pelo teste cometa. Nos resultados da análise química, foi observado aumento nos níveis de cádmio, cromo, cobre, níquel, chumbo e zinco em diferentes períodos amostrais, acima dos permitidos pela legislação brasileira. Em conjunto, esses resultados demonstraram uma alteração da qualidade das águas da Lagoa de Extremoz causada pela contaminação por metais pesados. Estes metais parecem estar interagindo com o material genético, visto o aumento nos níveis de quebras no DNA, identificados no teste Cometa. Contudo, os danos não estão sendo fixados pela célula. Diante disso, é importante recomendar um programa de monitoramento da presença de metais pesados, bem como de outros poluentes com potencial genotóxico, nessa área de estudo.
Ativação local da rota da quinurenina por moduladores inflamatórios durante a meningite bacteriana
(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2008-03-18) Coutinho, Leonam Gomes; Lima, Lucymara Fassarela Agnez; http://lattes.cnpq.br/1083882171718362; http://lattes.cnpq.br/1909294735239579; Checchinato, Cátia Mendes Pereira; http://lattes.cnpq.br/4124165196694369; Jerônimo, Selma Maria Bezerra; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4785584A3&dataRevisao=null
A ativação da rota da quinurenina por moduladores do sistema imune tem sido observada durante diversas doenças neurológicas. Neste trabalho foi avaliado a associação entre os níveis de citocinas e quimiocinas com a concentração dos metabólitos da rota da quinurenina ( Kynurenine pathway KP) em amostras de líquor e plasma de pacientes com meningite bacteriana. Todas as amostras foram coletadas de 42 pacientes hospitalizados com o diagnóstico de meningites bacteriana aguda, tuberculósica, asséptica e pacientes cujo diagnóstico excluiu infecção no sistema nervoso central. As concentrações dos metabólitos da quinurenina foram avaliadas pela cromatografia líquida de alta pressão enquanto os níveis de citocinas e quimiocinas foram medidos pelo Bio-plex 200 suspension array system. Concentrações de quinurenina e ácido quinurênico foram significativamente mais elevadas no líquor de pacientes com meningite bacteriana aguda do que nos outros grupos. Ainda no líquor, os níveis de triptofano, ácido antranílico, 3-hidroxiquinurenina e ácido 3-hidroxiantranílico não mostraram significância estatística, embora alguns deles apresentaram um bom acúmulo durante meningite bacteriana aguda. No líquor dos pacientes com meningite bacteriana foram observados níveis mais elevados de TNF-alfa, IL-6, IL-1beta, IFN-gama, IL-10, IL-1Ra, MIP-1alpha, MIP-1beta, MCP-1 e G-CSF do que os outros grupos infectados. Em todas as amostras, as concentrações de IL-2, IL-12(p70), IL-4, IL-8 e GM-CSF não variaram significativamente. No grupo com meningite bacteriana aguda foram também observadas elevadas concentrações de IL-6, IL-10, IL-1Ra e MCP-1 no plasma. Baseado na comparação das concentrações dos metabólitos da via quinurenina no líquor e no plasma, conclui-se que a ativação desta via metabólica durante a meningite ocorre primordialmente dentro do cérebro. O aumento na concentração dos metabólitos da quinurenina durante a infecção deve-se ativação da enzima idoleamina 2,3 dioxigenase por proteínas da resposta imune hospedeira principalmente pelo IFN-gama, IL1beta e TNF-alfa.
Análise do potencial genotóxico da superfície de titânio modificada por plasma
(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2008-03-26) Tavares, Joana Cristina Medeiros; Medeiros, Sílvia Regina Batistuzzo de; ; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781004Y8; ; http://lattes.cnpq.br/8980283503265456; Lima, Lucymara Fassarela Agnez; ; http://lattes.cnpq.br/1083882171718362; Ribeiro, Daniel Araki;
O Titânio (Ti) é atualmente o material mais utilizado para fabricação de implantes ortopédicos e dentais. Alterações na superfície de titânio comercial puro (TiCP) podem determinar a reposta funcional das células, sendo um fator crítico para o sucesso do implante. Entretanto, a genotoxicidade de superfícies de titânio tem sido pouco estudada. Deste modo, o objetivo deste trabalho foi avaliar o potencial genotóxico de uma nova superfície de titânio porosa desenvolvida por plasma comparada com uma superfície somente polida. Para tanto, foram realizados os ensaios cometa, aberrações cromossômicas (CAs) e micronúcleo (MN), utilizando células CHO-K1 (células do ovário de hamster Chinês). Nossos resultados revelaram que a superfície de titânio polida foi capaz de induzir um aumento significativo dos danos no DNA, no número das CAs, na tetraploidia e na freqüência de micronúcleos comparada ao controle. A superfície tratada por plasma, não promoveu efeito genotóxico significativo para todos os ensaios realizados. Estes resultados sugerem que a nova superfície de titânio tratada por plasma pode ser um material biologicamente seguro para sua utilização em implantes ou futura aplicação na terapia de regeneração óssea-guiada, ao menos no que se refere à sua genotoxicidade
Análise de polimorfismos dos genes da rota quinurenina em pacientes com meningite bacteriana.
(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2008-03-28) Souza, Fladjule Rejane Soares de; Lima, Lucymara Fassarela Agnez; ; http://lattes.cnpq.br/1083882171718362; ; http://lattes.cnpq.br/0992283321477924; Rabenhorst, Silvia Helena Baren; ; http://lattes.cnpq.br/3868264006150535; Scortecci, Kátia Castanho; ; http://lattes.cnpq.br/4808910380593455
A meningite bacteriana (MB) é uma doença infecciosa que causa morte e deixa graves seqüelas. Infecções bacterianas do sistema nervoso central (SNC) geram uma das mais poderosas respostas inflamatórias conhecidas, a qual contribui para os danos neuronais. Através de análises por Microarray foi possível observar alterações na Rota da Quinurenina (RQ) que são induzidas na MB e em outras doenças associadas com inflamação, levando a injúria cerebral. A RQ tem um papel crucial na patogênese da MB, produzindo neurotoxinas e espécies reativas de oxigênio. Nosso principal objetivo foi buscar SNPs previamente descritos no banco de dados do NCBI em enzimas da RQ e investigar uma possível associação destes SNPs com as alterações da RQ em pacientes com MB. Os pacientes incluídos neste estudo foram 33 homens e 24 mulheres, com idades variando entre 02 meses a 68 anos. Os SNPs foram localizados dentro do domínio conservado da cadeia polipeptídica das enzimas KYNU, IDO, KATI e KATII. Primers foram desenhados para análises do SNPs através da técnica do PIRA-PCR seguido por RFLP. A análise do SNP KYNU+693G/A mostrou uma freqüência de heterozigosidade de 0,033. Nós não encontramos freqüência alélica na população estudada para os SNPs KYNU+693G/A, KATI+164T/C, KATII650C/T e IDO+434T/G. Apesar de estudos anteriores mostrarem a importância da RQ, não foi encontrada uma associação dos SNPs estudados com a susceptibilidade ou a severidade das seqüelas da MB na população em estudo.
Evolução do reparo por excisão de nucleotídeo
(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2008-03-31) Silva, Uaska Bezerra e; Lima, Lucymara Fassarela Agnez; ; http://lattes.cnpq.br/1083882171718362; ; http://lattes.cnpq.br/9309987119591098; Melo, Vânia Maria Maciel; ; http://lattes.cnpq.br/1572504650930605; Medeiros, Sílvia Regina Batistuzzo de; ; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781004Y8
A filogenômica estuda os organismos através de análises comparativas das seqüências conservadas presentes em seus genomas visando encontrar alguma justificativa para a origem ou a evolução dos mesmos. Dentre as seqüências com elevado nível de conservação encontram-se os genes de reparo, pois são importantes para a conservação e manutenção da estabilidade genética. Por isso, variações em genes de reparo, como os da via de excisão de nucleotídeos (REN), podem indicar uma possível transferência gênica entre espécies. O presente trabalho teve o objetivo de analisar a história evolutiva dos componentes do REN. Para isso, seqüências de UVRA, UVRB, UVRC e XPB foram obtidas a partir do GenBank por Blast-p, considerando-se 10-15 como limiar, com o fim de criar um banco de dados. Estudos filogenéticos foram feitos utilizando algoritmos presentes nos programas PAUP, BAYES e no pacote PHYLIP. Foram construídas árvores com seqüências protéicas e com seqüências de RNA ribossômico 16S para análises comparativas através dos métodos de parcimônia, verossimilhança e bayesiano. De acordo com a árvore de XPB, as helicases dos eucariotos são similares as das arqueobactérias e apresentam comportamento semelhante ao longo da evolução, ou seja, compartilham um mesmo ancestral. Nas filogenias feitas para cada proteína do sistema uvrABC, foram encontradas três espécies da classe epsilonproteobacterias, três espécies da classe mollicutes e arqueobacterias das classes Methanobacteria e Methanococci formando um grupo monofilético. Esse dado é fortalecido através de uma árvore obtida com as proteínas, UVRA, UVRB e UVRC concatenadas. Assim, embora existam argumentos, na literatura, defendendo a transferência horizontal do sistema uvrABC de bactérias para arqueobactérias, a análise feita neste estudo sugere que a transferência vertical, tendo arquebacterias como origem, tanto do sistema uvrABC quanto dos genes XP, seja o caminho mais parcimonioso, considerando a ocorrência de grupos monofiléticos, o tempo de divergência das classes e o número de espécies e arqueobactérias portadoras dos genes do sistema uvrABC

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