PPGGBM - Mestrado em Genética e Biologia Molecular
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Dissertação Caracterização de dois cDNAs homológos e uma AP endonuclease em cana-de-açúcar(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2009-02-27) Oliveira, Andrea de Lima; Scortecci, Kátia Castanho; http://lattes.cnpq.br/4808910380593455; http://lattes.cnpq.br/9710432901164124; Lima, Lucymara Fassarela Agnez; http://lattes.cnpq.br/1083882171718362; Sluys, Marie-anne Van; http://lattes.cnpq.br/5131787064674647O genoma de todos os organismos está sujeitos a lesões que podem ser causados por fatores endógenos e ambientais. Uma vez no genoma, as lesões podem levar a formação e acúmulo de mutações, as quais podem ser prejudiciais ao desenvolvimento do organismo. As vias de reparo de DNA são um mecanismo que permite o organismo detectar e corrigir essas lesões ou minimizar seus efeitos. Várias vias de reparo de DNA são conhecidas e bem caracterizadas em animais e microorganismos. Em plantas, as vias de reparo ainda não são bem caracterizadas, mas muitas pesquisas têm revelado a participação de todas as vias conhecidas no reparo do genoma das plantas, sendo os modelos mais estudados Arabidopsis thaliana e Oriza sativa. A via de reparo de interesse deste trabalho é a via de BER, a qual apresenta várias proteínas atuando no reparo do DNA. Porém, a classe de proteínas da via BER focadas são as AP endonucleases, responsáveis pela hidrólise do sítio AP. Este trabalho teve como objetivo caracterizar dois cDNAs de cana-de-açúcar: scARP1 e scARP3, homólogos a AP endonucleases de A.thaliana e identificados num trabalho de data-mining do projeto SUCEST. Para tanto, foram construídos cassetes de super-expressão, contendo o cDNA scARP1 sob o controle do promotor forte 35S. Além disso, anteriormente no laboratório foi obtido uma planta de icotiana tabacum contendo o cassete de super-expressão (35S+scARP1) em orientação anti-senso. Foi analisado o desenvolvimento desta planta, e foram obtidas também algumas sementes (T2) desta planta. Estas sementes foram germinadas e analisadas quanto à presença do cassete de super-expressão e desenvolvimento. Além disso, para estes dois genes foram clonados as regiões promotoras por PCR walking. Os fragmentos obtidos foram clonados, sequenciados e, analisados por meio do programa PLANTCARE. Os motivos encontrados nessas regiões dos genes de cana-de-açúcar foram comparados com potenciais regiões promotoras das plantas de Arabidopis, O. sativa e S. bicolor. Estas análises mostraram a presença de diferentes motivos relacionados à respostas ao estresse oxidativoDissertação Diversificação cariotípica em cinco espécies de moréias do Atlântico Ocidental (Anguilliformes)(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-23) Vasconcelos, Antônio Jales Moraes; Molina, Wagner Franco; ; http://lattes.cnpq.br/8437464961129518; ; http://lattes.cnpq.br/8784507023640851; Affonso, Paulo Roberto Antunes de Mello; ; http://lattes.cnpq.br/4149576837587664; Panosso, Renata de Fátima; ; http://lattes.cnpq.br/2543467420133635Os Anguiliformes são constituídos por 15 famílias, 141 gêneros e 737 espécies. Neste grupo oito famílias possuem pelo menos uma espécie cariotipada, onde é evidenciada uma prevalência de cariótipos com 2n=38 cromossomos e NF elevados, aparentemente basal para os Anguiliformes. A única família que exibe um padrão cariotípico diferente das demais é a família Muraenidae. Nesta, das oito espécies já descritas, todas apresentam 2n=42 cromossomos. Apesar da dimensão desta Ordem, poucas espécies apresentam descrições cariotípicas. No presente trabalho, uma espécie de Ophichthidae, Myrichthys ocellatus (2n=38; 8m+14sm+10st+6a; NF=70) e quatro espécies de Muraenidae, Enchelycore nigricans (2n=42; 6m+8sm+12st+16a; NF=68), Gymnothorax miliaris (2n=42; 14m+18sm+10st; NF=84), Gymnothorax vicinus (2n=42; 8m+6sm+28a; NF=56) e Muraena pavonina (2n=42; 6m+4sm+32a; NF=52), coletadas no litoral do Rio Grande do Norte, Arquipélago de São Pedro e São Paulo e litoral da Bahia, foram analisadas. Cromossomos mitóticos foram obtidos através de preparações de curto termo, precedidas por estimulação mitótica com levedura. Entre as espécies observa-se a presença de grandes pares cromossômicos metacêntricos (≅10µm) característicos. Quanto aos padrões estruturais nestas espécies foram evidenciadas regiões heterocromáticas em posição centromérica da maioria dos pares cromossômicos e sítios ribossomais simples. Para a família Ophichthidae, os dados obtidos corroboram a hipótese de diversificação cariotípica mediada pela ocorrência de inversões pericêntricas e rearranjos robertsonianos, enquanto que nos Muraenidae, a identificação de valores cromossômicos maiores (2n=42), sugere cariótipos mais derivados, possivelmente ocasionados por possíveis fissões cromossômicasDissertação Caracterização da resistência do algodoeiro a Ramularia areola e variabilidade molecular do patógeno(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-23) Lucena, Valeska Silva; Hoffmann, Lúcia Vieira; ; http://lattes.cnpq.br/1552220402943995; ; http://lattes.cnpq.br/4490260435452349; Suassuna, Nelson Dias; ; http://lattes.cnpq.br/4344026717541727; Giband, Marc; ; http://lattes.cnpq.br/0551184684899446Este estudo teve como objetivos estudar a estrutura genética e patogênica de isolados de Ramularia areola do Brasil e caracterizar a resposta de resistência no algodoeiro à mancha-de-ramulária. Foi avaliada a variabilidade genética de 28 isolados do patógeno, utilizando-se marcadores RAPD. A avaliação da patogenicidade de 6 desses isolados foi realizada após a inoculação nas variedades Guazuncho-2 (Gossypium hirsutum) suscetível e VH8-4602 (Gossypium barbadense) resistente à doença. A herança da resistência no algodoeiro à doença foi caracterizada pela medição de intensidade da doença nas variedades Guazuncho-2 (G. hirsutum), suscetível, e VH8-4602 (G. barbadense), resistente à doença, e nas gerações F1 e F2 provenientes do cruzamento entre elas. O polimorfismo molecular entre as linhagens de G. hirsutum DeltaOpal e CNPA CO11612, contrastantes fenotipicamente quanto à resistência à doença foi avaliado utilizando-se 118 marcadores SSR e 24 AFLP. Para mapeamento molecular dos genes de resistência, linhagens recombinantes RIL s derivadas do cruzamento entre Guazuncho-2 e VH8-4602 foram genotipadas utilizando marcadores SSR. A análise da estrutura da população de R. areola revelou que as três subpopulações foram semelhantes geneticamente (Gst=0.18). Os isolados de Goiás e Minas Gerais obtiveram maior similaridade genética (0,92), que pode estar associada com o alto fluxo genético existente entre as subpopulações que foi de (Nm=2.20). Quanto à patogenicidade, os isolados de R. areola 9.1, coletado no estado de Minas Gerais, 8.2 e 8.3 de Goiás, foram mais agressivos na variedade suscetível Guazuncho-2. A variedade VH8-4602 apresentou alto nível de resistência à doença. Não foi observada interação diferencial entre os patógenos e as variedades analisadas, sendo a resistência classificada como horizontal. Na análise dos indivíduos das gerações F1 e F2, provenientes do cruzamento entre Guazuncho-2 e VH8-4602, a quantificação de sintomas da doença através da contagem de manchas necróticas e pelo número de esporos mostrou variação contínua da resistência à doença nos indivíduos da geração F2, indicando que a herança é poligênica. O aparecimento de sintomas e esporulação nos indivíduos F1 mostrou que a resistência é recessiva. O polimorfismo molecular entre as linhagens de G. hirsutum, DeltaOpal e CNPA CO11612 foi de 6%, portanto baixo, para realizar o mapeamento. Durante genotipagem das RIL´s foi verificado que 25% dos marcadores segregaram de acordo com as proporções das leis de Mendel, e 75% desses marcadores apresentaram distorção de segregação, com aumento da proporção de genes do parental G. hirsutum. A baixa variabilidade do patógeno e número de genes de resistência sugere que a resistência genética ao patógeno tenha alta durabilidadeDissertação Análise molecular dos éxons 8 a 11 do gene da p53 em amostras de câncer de colo de útero no Rio Grande do Norte(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-23) Barbosa, Rodrigo Niskier Ferreira; Meissner, Rosely de Vasconcellos; ; http://lattes.cnpq.br/7518973237001429; ; http://lattes.cnpq.br/7870682050323416; Rabenhorst, Silvia Helena Baren; ; http://lattes.cnpq.br/3868264006150535; Fernandes, José Veríssimo; ; http://lattes.cnpq.br/7078820975978056; Blaha, Carlos Alfredo Galindo; ; http://lattes.cnpq.br/2307806644081146As mutações no TP53 são frequentes nos cânceres humanos, mas não no câncer do colo do útero onde são raramente detectadas e a inativação e degradação da p53 é atribuída à ação do oncogene viral E6 dos papilomavírus humanos (HPVs) de alto risco. A partir da análise de linhagens celulares de carcinoma cervical foi sugerido que carcinomas cervicais HPV negativos apresentavam mutações no TP53, mas a análise de amostras clínicas não confirmou esta hipótese. Entretanto, na maioria dos estudos de mutações do TP53 no câncer de colo do útero foram analisados principalmente os éxons 5 a 8, região onde estão localizadas cerca de 90% das mutações descritas neste gene. Estudos recentes em diferentes tipos de câncer sugerem que a freqüência de mutações nos demais éxons do TP53 não é desprezível. O objetivo deste trabalho foi verificar se ocorrem mutações em regiões codificantes e não codificantes do TP53 humano em amostras de tecido de câncer de colo do útero de pacientes no Rio Grande do Norte utilizando eletroforese em gel com gradiente de desnaturação (DGGE) como técnica de triagem. Foram analisados os exons 8 a 11, incluindo alguns introns, de 80 amostras de tumor e 8 amostras de sangue periférico de mulheres saudáveis. O DNA obtido das amostras foi amplificado por PCR usando iniciadores com grampo GC na extremidade de um deles. Os resultados para cada região foram visualizados após DGGE e coloração por nitrato de prata. Não foram observadas bandas amplificadas com padrão de migração diferente das obtidas de DNA de sangue periférico. Estes resultados estão de acordo com os descritos na literatura onde mutações no TP53 no câncer do colo do útero têm sido descritas com freqüência muito baixaDissertação Desenvolvimento de sistemas farmacêuticos emulsionados para veiculação gênica(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-26) Veríssimo, Lourena Mafra; Egito, Eryvaldo Sócrates Tabosa do; Lima, Lucymara Fassarela Agnez; ; http://lattes.cnpq.br/1083882171718362; ; http://lattes.cnpq.br/6907806915889763; ; http://lattes.cnpq.br/9173400981540256; Magalhães, Nereide Stella Santos; ; Medeiros, Sílvia Regina Batistuzzo de; ; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781004Y8Terapia gênica, em uma ampla definição, é o tratamento de doenças baseado na transferência de material genético a uma célula, tecido ou órgão com o intuito de curar ou melhorar o estado clínico do paciente. Em sua forma mais simples, a terapia gênica consiste na inserção de genes funcionais em células com genes defeituosos objetivando substituir, complementar ou inibir esses genes causadores de doenças. Para que o DNA exógeno seja expresso em uma população celular faz-se necessária a sua transferência até o local. Assim, é necessário criar veículos, os vetores, que transportem e protejam o DNA até que este chegue a uma população celular alvo. Os obstáculos encontrados com a utilização de vetores virais têm proporcionado o interesse no desenvolvimento de emulsões catiônicas como vetores não-virais, por serem fáceis de produzir, apresentarem estabilidade controlável e facilitarem a transfecção gênica. O objetivo deste trabalho foi desenvolver um sistema emulsionado para terapia gênica e avaliar sua capacidade de compactação de ácidos nucléicos através da sua associação com o plasmídeo pIRES2-EGFP. Primeiramente o EHLc do TCM utilizado, o Captex® 355, foi determinado através de ensaios de estabilidade acelerada e a longo termo. Com base nos resultados obtidos, emulsões de EHL 10,7 compostas de Captex® 355, Tween 20® e Span 60® foram preparadas pelos métodos de inversão de fases, emulsificação espontânea e sonicação e elegeu-se o melhor método para o preparo das emulsões catiônicas. As emulsões de menor granulometria e maior estabilidade foram obtidas através do método de sonicação. As emulsões catiônicas foram preparadas acrescendo-se à emulsão base o DOTAP e a sua associação com o pIRES2-EGFP foi avaliada através da técnica de eletroforese em gel de agarose. Várias proporções de emulsão e DNA foram testadas e os resultados demonstraram que houve formação de 100% dos complexos quando a proporção DOTAP/DNA(nmol/µg) foi igual a 130. Em conclusão, o conjunto dos resultados obtidos demonstra a capacidade da emulsão proposta neste trabalho de compactar o DNA, requisito necessário para uma boa transfecção, tornando a formulação uma forte candidata à utilização em terapia gênicaDissertação Avaliação da genotoxicidade das águas sueprficiais da Barragem Engenheiro Armando Ribeiro Gonçalves, Assu/RN(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-28) Cabral, Thiago de Melo; Medeiros, Sílvia Regina Batistuzzo de; Panosso, Renata de Fátima; ; http://lattes.cnpq.br/2543467420133635; ; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781004Y8; ; http://lattes.cnpq.br/1599632696789745; Hacon, Sandra de Souza; ; http://lattes.cnpq.br/7653379361147439; Lima, Lucymara Fassarela Agnez; ; http://lattes.cnpq.br/1083882171718362A contaminação de reservatórios de água é um dos principais problemas da atualidade. A Barragem Engenheiro Armando Ribeiro Gonçalves (EARG), (06º08 S; 37º07 W) localizada no estado do Rio Grande do Norte, é a segunda maior barragem do nordeste brasileiro, responsável pelo abastecimento doméstico de aproximadamente 415 mil habitantes do semi-árido brasileiro. A água da EARG é captada por um sistema de adutoras, onde é tratada e distribuída para a população. O presente trabalho teve o objetivo de avaliar o potencial genotóxico da água da Barragem EARG. Para isso, foram realizados os testes cometa e micronúcleo com eritrócitos de tilápias (Oreochromis niloticus) capturadas nesse reservatório. Os testes Allium cepa e mutação reversa com Salmonela typhimurium foram realizados com água do reservatório antes e após o tratamento. Além disso, análises quantitativa e qualitativa de cianobactérias, assim como a quantificação das microcistinas produzidas pelas cianobactérias presentes nesse reservatório foram realizados, apenas com amostras coletadas na barragem. Os resultados obtidos indicaram aumento significativo na freqüência de micronúcleos em eritrócitos de O. niloticus (p<0,05). A média obtida foi de 2,38 ± 3,02 micronúcleos em mil células analisadas, enquanto que o controle negativo apresentou média de 0,20 ± 0,41 micronúcleos. O ensaio cometa realizado com peixes da EARG foi analisado em uma escala crescente de danos (0 - 4), e mostrou resultados classificados nos níveis 0, 1, 2 e 3, enquanto que o controle negativo apresentou resultados nos níveis 0 e 1. Nos parâmetros macroscópicos avaliados no teste A. cepa não foi verificado alterações estatisticamente significativas. Os parâmetros microscópicos indicaram diminuição significativa no índice mitótico nos dois pontos estudados. Além disso, também foi detectado aumento na freqüência de metáfases e anáfases aberrantes em ambos os pontos, porém estatisticamente significativo apenas na amostra sem tratamento para anáfases aberrantes. A freqüência de micronúcleos no teste A. cepa não foi significativo em relação ao controle negativo. Para o teste de mutação reversa com S. typhimurium realizado com água sem extração, os resultados não demonstraram mutagenicidade para ambos os pontos. Os resultados encontrados com os extratos das amostras coletadas em ambos os pontos apresentaram diferenças estatisticamente significativa quando foi utilizada a fração S9 como ativador metabólico. Para a água não tratada, essas diferenças foram encontradas apenas para a cepa TA98, enquanto que para a água tratada, as duas linhagens apresentaram diferenças significativas. A análise qualitativa de cianobactérias demonstrou a existência de cianobactérias potencialmente tóxicas tais como Planktothrix agardii, Cylindrospermopsis raciborskii e Microcystis panniformes. O ensaio de HPLC indicou a presença de 38,1 μg/L de microcistinas na água da EARG. O teste de mutação reversa realizado com o extrato contendo microcistinas, não apresentou aumento na razão de mutagenicidade para TA100. O conjunto dos resultados obtidos no presente trabalho sugere que as águas da Barragem EARG podem conter agentes genotóxicos, capazes de alterar a informação genética dos indivíduos. Esses resultados indicam a necessidade de um programa de monitoramento e controle desses poluentesDissertação Caracterização dos genes scMUTM1 e scMUTM2 de cana-de-açúcar(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-23) Medeiros, Viviane Katielly Silva; Scortecci, Kátia Castanho; ; http://lattes.cnpq.br/4808910380593455; ; http://lattes.cnpq.br/0635169659175207; Lima, Lucymara Fassarela Agnez; ; http://lattes.cnpq.br/1083882171718362; Machado, Carlos Renato; ; http://lattes.cnpq.br/6306925202374274As plantas são organismos particularmente susceptíveis aos efeitos genotóxicos devido a sua constante exposição a agentes do meio ambiente tais como a luz [incluindo a ultravioleta (UV)], o calor, a seca e diferentes substâncias químicas. Entretanto, existem diferentes mecanismos de reparo para detectar estas lesões e corrigi-las. Entretanto, em plantas estas vias são pouco compreendidas. Uma das vias é a por excisão de bases (BER). A proteína MUTM/FPG é uma DNA glicosilase da via BER que corrige danos oxidativos. No genoma da cana-de-açúcar foram encontrados dois possíveis cDNAs que possuem homologia de seqüência a esta proteína: scMUTM1 e scMUTM2. O objetivo deste trabalho foi caracterizar o papel destes genes em plantas. Para isto, o nível de expressão dos genes após estresse oxidativo foi avaliado através de RT-PCR semiquantitativo. Para obter a sequência completa dos gene, uma biblioteca de DNA genômico de cana-de-açúcar foi hibridizada com sondas radioativas para ambos cDNAs, encontrando-se dois clones em potencial. A região promotora foi clonada, seqüenciada e analisada. Dentro das seqüências obtidas para a região promotora de scMUTM2, estas podem ser divididas em seis grupos. Os motivos regulatórios foram identificados, tais como o TATA-box, CAAT-box, elementos de resposta ao estresse oxidativo e elementos de resposta à luz. Um outro ponto de interesse neste trabalho foi a caracterização da região N-terminal da proteína scMUTM1. Para isto, foram realizadas algumas construções via PCR. Estas construções foram posteriormente introduzidas em cepas selvagem (CC104) e duplo mutante (CC104mutMmutY) de Escherichia coli e foram realizados ensaios de complementação de modo a avaliar a importância de cada região para o reconhecimento e correção das lesões. Os resultados mostraram que as proteínas com deleções na porção N-terminal de scMUTM1 são capazes de complementar a deficiência de Fpg and MutY-glicosilase na bactéria CC104 mutMmutY reduzindo assim a freqüência de mutação espontâneaDissertação Prospecção e caracterização de genes associados ao processo de indução floral em cana-de-açúcar(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-28) Furtado, Cristiane Miranda; Scortecci, Kátia Castanho; ; http://lattes.cnpq.br/4808910380593455; ; http://lattes.cnpq.br/8733809210008076; Vidal, Márcia Soares; ; http://lattes.cnpq.br/3036544314910366; Grangeiro, Thalles Barbosa; ; http://lattes.cnpq.br/3114375474778667A região nordeste é responsável por 14,32% da produção nacional de cana-de-açúcar. Esta contribuição reduzida é devido às condições edafo-climáticas da região. A floração é um processo vital para a planta que consome muita energia e culmina num fenômeno denominado de isoporização do colmo. Esta isoporização pode acarretar numa redução de até 60% na produção de álcool e açúcar. Considerando que a cana-de-açúcar cultivada corresponde a um híbrido com o genoma octaploide, existem variedades com um padrão de florescimento precoce até um padrão de não florescimento. Utilizando este potencial genético natural presente nas diferentes cultivares de cana-de-açúcar na região nordeste, o objetivo do presente trabalho foi de compreender como ocorre esse processo de floração por meio da metodologia de bibliotecas subtrativas. O RNA total foi extraído utilizando o reagente Trizol (Invitrogen) de ápices meristemáticos de cultivares com florescimento precoce induzida e não induzida e outra com florescimento tardio. A partir deste RNA total foram construídas as quatro bibliotecas subtrativas (B1 florescimento precoce induzida subtraída da tardia não-induzida; B2 florescimento tardio não-induzida subtraído da precoce induzida; B3 precoce induzida subtraída da precoce não-induzida; B02 precoce não-induzida subtraída da precoce induzida), utilizando os kits Super Smart cDNA syntesis e o kit BD Clontech PCR select cDNA subtraction (Clontech). Este material foi clonado no vetor pGEM T-easy (Promega) e transformados em células competentes de E. coli DH10B. A análise das seqüências obtidas foi realizada utilizando o programa BLASTn contra o banco de dados do NCBI e do genoma de Arabidopsis thaliana, arroz e milho. Os clones foram agrupados em 9 diferentes classes de acordo com a função. Alguns fatores de transcrição já relatados como participantes da via de indução floral foram identificados nas diferentes bibliotecas. Além disso, proteínas associadas com o ciclo celular e seu controle também estavam presentes, destacando-se nesse grupo as proteínas quinases. Fatores relacionados à síntese protéica, metabolismo, defesa, transporte e comunicação celular, também foram obtidos em ambas bibliotecas. Alguns genes identificados nas bibliotecas não apresentaram similaridade nos bancos de dados ou apresentaram homologia com genes de função hipotética, e podem representar novos genes a serem depositados em bancos de dados internacionais. Estes resultados sugerem que alguns dos genes identificados em cana-de-açúcar, classificados tanto na classe de fatores de transcrição, ciclo celular e comunicação celular, além dos genes não conhecidos, possam estar associados com a variabilidade genética para o processo de floração encontrada na região nordesteDissertação Avaliação da genotoxicidade das águas do lençol freático sob a Universidade Federal do Rio Grande do Norte(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-28) Oliveira, Givanilson Brito de; Lima, Lucymara Fassarela Agnez; ; http://lattes.cnpq.br/1083882171718362; ; http://lattes.cnpq.br/4438490047829028; Medeiros, Sílvia Regina Batistuzzo de; ; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781004Y8; Lemos, Clarice Torres de; ; http://lattes.cnpq.br/5348706405357207As águas subterrâneas representam o suprimento mais importante de água doce do planeta. Diariamente, em todo planeta, uma grande quantidade de material tóxico e genotóxico atingem os sistemas aquáticos, principalmente os aqüíferos. O aqüífero Barreiras, através de cinco poços, é responsável pelo abastecimento da Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN). Todos os poços encontram-se contaminados com nitrato e alguns metais pesados. Dois deles foram desativados. A genotoxicidade das amostras das águas subterrâneas do aqüífero Barreiras na UFRN foi avaliada usando os teste Allium cepa, o teste de Ames e o teste de microsuspensão com Salmonella typhimurium (Teste de kado). Para o teste Allium cepa a influência das amostras de água subterrâneas coletadas nos parâmetros macroscópicos (crescimento, coloração e forma da raiz), microscópico (índice mitótico, aberrações cromossômicas e micronúcleo) foram examinadas. Todas as amostras de água causaram aumento significante na freqüência de aberrações cromossômicas e mitóticas e redução no crescimento das raízes comparando com o controle negativo. Pontes e cromossomos stickness foram os tipos de aberrações mais freqüentes nas células em divisão. Além disso, quebras de DNA também foram observadas. Não foi encontrado aumento significante no número de micronúcleos comparando com o controle negativo. Para execução do teste de Ames, aplicando o método direto foram usadas às linhagens de Salmonella typhymurium TA98 e TA100 sem ativação metabólica. As amostras de água foram submetidas ao processo de concentração em resina XAD antes do teste de Kado. Extração orgânica foi realizada em colunas contendo resina XAD4 que absorve uma grande classe de compostos mutagênicos. A mutagenicidade dos extratos orgânicos foi avaliada pelo teste de Kado usando as linhagens TA98 e TA100, na ausência e na presença da fração S9 (ativação metabólica). As concentrações de sete metais pesados foram medidas nas amostras de água, apenas os níveis de Ni, Cu e Cr excederam os níveis máximos de concentrações permitidas para os reservatórios naturais. Os resultados obtidos para a atividade mutagênica usando o teste de Ames foi negativo em todas amostras de água bruta analisadas. Resultados positivos com o extrato da resina XAD4 das amostras de água foram obtidos para cepa TA98 na presença da fração S9 para duas amostras. Metais pesados e nitrato podem estar correlacionadas com a toxicidade e genotoxicidade observada nas amostras de água analisadas. O efeito mutagênico detectado com a linhagem TA98 sugere que compostos orgânicos (depois de metabolizados) causaram a mutagenicidade detectada nas amostras analisadas. Em conjunto, os dados obtidos neste trabalho indicam a presença de pelo menos duas classes de mutágenos: compostos orgânicos e inorgânicosDissertação Qualidade fisiológica de sementes de genótipos de algodoeiro sob estresse salino(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-28) Lima, Leonardo Henrique Guedes de Morais; Vidal, Márcia Soares; Lima, Marleide Magalhães de Andrade; ; http://lattes.cnpq.br/1171370761724298; ; http://lattes.cnpq.br/3036544314910366; ; http://lattes.cnpq.br/9250206525235408; Fernandes, Pedro Dantas; ; http://lattes.cnpq.br/4411670211010251; Scortecci, Kátia Castanho; ; http://lattes.cnpq.br/4808910380593455A germinação de sementes de algodão e a emergência de plântulas são geralmente retardadas e reduzidas pela salinidade. Embora o algodão seja considerado uma cultura tolerante, pode sofrer reduções substanciais no seu crescimento e na produção quando exposta à condição de salinidade. O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito do estresse salino na fase de germinação em quatro genótipos de algodão (BRS Rubi, BRS Safira, BRS 201 e CNPA 187 8H), empregando-se diferentes potenciais osmóticos, gerados com acréscimo de cloreto de sódio (NaCl). O estresse salino foi simulado, utilizando-se soluções aquosas de NaCl nos potenciais 0,0; -0,2; -0,4; -0,6; -0,8 e -1,0 MPa. Os tratamentos foram monitorados por meio de testes para análise de sementes: germinação, primeira contagem, índice de velocidade de germinação (IVG), comprimento de parte aérea, comprimento de radícula, peso seco de eixo embrionário e relação radícula/parte aérea. Os testes para germinação, primeira contagem e IVG foram realizados utilizando-se 50 sementes por repetição; para o estudo de comprimento de parte aérea, comprimento de radícula, peso seco de eixo embrionário e relação radícula/parte aérea, foram utilizadas 20 sementes por repetição. Para ambos os testes, foram realizadas quatro repetições por genótipo para cada um dos potenciais. As sementes de cada repetição foram envolvidas em papéis Germitest umedecidos com a solução de NaCl correspondente ao potencial. As repetições de ambos os testes foram conduzidas em germinador e a umidade mantida ao ponto de saturação. As leituras das três primeiras variáveis analisadas foram iniciadas quatro dias após a indução do estresse salino. As avaliações foram realizadas diariamente; as sementes foram retiradas e contabilizadas à medida que ocorria a germinação. Para os testes de comprimento, apenas as repetições correspondentes ao potencial de NaCl 0,0 MPa foram lidas, quatro dias após o início da indução do estresse. As leituras das repetições dos potenciais -0,2 e -0,4 e dos potenciais -0,6, -0,8 e -1,0 MPa foram realizadas, respectivamente, aos 12º e 20º dias. Para a realização das leituras deste teste, a parte aérea das 20 plantas de cada repetição foi separada da radícula e ambas mensuradas. As análises estatísticas foram efetuadas, utilizando-se os procedimentos GENMOD e GLM do SAS. Para a variável germinação, as cultivares CNPA 187 8H e BRS Safira destacaram-se para o potencial -0,8 MPa, com médias de 89% e 81%, respectivamente. Foi observado que o aumento do potencial salino reduziu a porcentagem do IVG. Para cada dia de avaliação, verificou-se que o aumento do potencial salino provoca uma redução do comprimento da parte aérea e da radícula. A radícula tende a crescer mais que a parte aérea até o potencial -0,4 MPaDissertação Padrões cariotípicos em tetraodontiformes (Osteichthypes) :redução genômica e mecanismos de diversificação(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-26) Lima, Lorena Corina Bezerra de; Molina, Wagner Franco; ; http://lattes.cnpq.br/8437464961129518; ; http://lattes.cnpq.br/1493167465165613; Fernandes, José Veríssimo; ; http://lattes.cnpq.br/7078820975978056; Affonso, Paulo Roberto Antunes de Mello; ; http://lattes.cnpq.br/4149576837587664RESUMO A ordem Tetraodontiformes é composta por cerca de 400 espécies de peixes, distribuídas em dez famílias, com distribuição circuntropical. A diversidade morfológica de cada família reflete em, parte, os diferentes níveis de especialização. Este grupo representa uma linhagem pós-Perciformes e constitui o último ramo da difusão dos Teleósteos, ocupando uma posição filogenética de destaque. Nesta ordem encontram-se algumas das espécies de peixes mais conhecidas popularmente, os baiacus, famílias Diodontidae e Tetraodontidae; e os cangulos, famílias Balistidae e Monacanthidae. Existem diversos trabalhos examinando as relações filogenéticas dos Tetraodontiformes e, em todos, estas famílias são reconhecidas como grupos irmãos, sendo Diodontidae mais próximo de Tetraodontidae e Balistidae mais próximo de Monacanthidae. Embora possua um número representativo de espécies, são poucos os trabalhos citogenéticos envolvendo exemplares das famílias Balistidae e Monacanthidae, especialmente espécies insulares. Neste trabalho foram analisadas citogeneticamente as espécies Cantherhines macrocerus, Cantherhines pullus (Monacanthidae), Melichthys niger (Balistidae), Sphoeroides testudineus (Tetraodontidae) e Chilomycterus antennatus (Diodontidae); através de coloração convencional, Ag-RONs e bandamento C. Diante das diferentes tendências de evolução cariotípicas apresentadas pelos Tetraodontiformes, o presente trabalho também buscou verificar a existência de relação entre o tamanho total dos cromossomos com a quantidade de DNA nestes grupos de Tetraodontiformes. Para tal, foram correlacionados o tamanho total do complemento haplóide destas espécies, com valores de conteúdo de DNA disponíveis na literatura. As análises citogenéticas para as espécies C.macrocerus, C.pullus (Monacanthidae) e M.niger (Balistidae), revelaram um cariótipo composto de 40 cromossomos, todos acrocêntricos. Todas possuem apenas um par de RONs e heterocromatina pericentromérica. Para S.testudineus o número diplóide encontrado foi igual a 2n=46, com NF=78 (16m+18sm+8st+4a), enquanto que para C.antennatus possui 2n=50, com NF=76 (4m+22st+24a). Ambas espécies possuem RONs simples e blocos heterocromáticos centroméricos. Em M. niger, a presença de marcação positiva (heterocromatina e RON) na constrição secundária no 2°par cromossômico em M. niger sugerindo a ocorrência de um rearranjo, possivelmente uma fusão envolvendo estes homólogos, indicando que estes eventos foram importantes para o estabelecimento dos cariótipos deste grupo.A manutenção da constância cariotípica encontrada nas populações de C. macrocerus (Monacanthidae) e Sphoeroides testudineus (Tetraodontidae) talvez se deva pelo favorecimento do fluxo gênico através das correntes oceânicas. Estes dados contrastam com os citótipos diferenciados de C.antennatus entre a costa Nordeste e Sudeste, sugerindo que os padrões ecológicos de cada espécie, somados às condições do meio ambiente marinho, possam ser responsáveis pela delineação cariotíopica de cada espécie. As características citogenéticas encontradas para as espécies C.macrocerus, C.pullus, M.niger, S.testudineus e C.antennatus somam-se aos dados disponíveis para outras espécies de Tetraodontiformes. A partir dos dados obtidos no presente estudo, pode-se inferir que o conteúdo de DNA possui relação direta com o comprimento total do genomaDissertação Levantamento cariotípico em espécies de peixes marinhos costeiros de fundo arenoso (Osteichthypes, Perciformes)(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-27) Accioly, Ingrid Vilar; Molina, Wagner Franco; ; http://lattes.cnpq.br/8437464961129518; ; http://lattes.cnpq.br/9890715324172958; Affonso, Paulo Roberto Antunes de Mello; ; http://lattes.cnpq.br/4149576837587664; Blaha, Carlos Alfredo Galindo; ; http://lattes.cnpq.br/2307806644081146Análises citogenéticas em peixes são importantes porque os mesmos compõem um grupo particular entre os vertebrados, ocupando posição central na evolução animal. A Ordem Perciformes, dominante nos ambientes marinhos e dulcícolas, constitui um modelo potencialmente útil na avaliação genética de populações, como também no entendimento de seus processos evolutivos. Apesar disto, ainda são escassos os estudos citogenéticos neste grande grupo, sobretudo para os habitantes de fundo arenoso e hábitos pelágicos. O presente trabalho se propôs a contribuir para a caracterização citogenética de nove espécies de peixes marinhos litorâneos de fundo arenoso do litoral do Rio Grande do Norte (Brasil), identificando os padrões evolutivos relacionados ao cariótipo nestas espécies e a existência de afinidades filogenéticas entre elas e outros Perciformes. Os animais foram coletados nas praias da Redinha, Ponta Negra e Búzios (Litoral do Rio Grande do Norte) e no Arquipélago de São Pedro e São Paulo. Posteriormente foram submetidos às técnicas citogenéticas que consistem em estimulação mitótica, obtenção de cromossomos mitóticos, seguida por técnicas de coloração convencional (Giemsa) e bandamentos cromossômicos (Ag-RONs e bandamento C). Número diplóide e número fundamental iguais a 48 foram observados na maioria das espécies: Menticirrhus americanus, Ophioscion punctatissimus, Pareques acuminatus (Sciaenidae); Chloroscombrus chrysurus (Carangidae); Echeneis sp. 2 (Echeneidae); Archosargus probatocephalus (Sparidae) e Orthopristis ruber (Haemulidae). Trachinotus goodei (NF=52) (Carangidae) e Echeneis sp. 1 (Echeneidae) (NF=54) apresentaram uma variação no NF, mantendo-se constante um número diplóide igual a 48. As RONs estavam situadas em posição pericentromérica em todas os scianídeos, e nas espécies Echeneis sp. 2 (22° par), O. ruber e A. probatocephalus (1° par), coincidindo com grandes blocos heterocromáticos em M. americanus (1° par), P. acuminatus (2° par) e O. ruber (1° par). As RONs também foram localizadas na região telomérica do braço curto do 5° e 11° pares acrocêntricos em T. goodei, 4° e 19° pares de C. chrysurus, 1° par (sm) de Echeneis sp. 1. O bandamento C detectou blocos centroméricos na maioria dos cromossomos das espécies de Sciaenidae, Carangidae e Echeneidae, com grandes blocos em A. probatocephalus (4° par). Blocos heterocromáticos em regiões teloméricas em submetacêntricos de Echeneis sp. 1, e pericentroméricas em M. americanus (1° e 8° pares), O. punctatissimus (1° par) e P. acuminatus (2° par) também foram observados. Nota-se um marcante conservadorismo cromossômico nas espécies da família Scianidae e Haemulidae no que diz respeito ao número de cromossomos acrocêntricos e a localização das RONs. Porém é destacada a presença de eventos de heterocromatinização durante a evolução cariotípica desta família. Já nas famílias Sparidae e Carangidae, os resultados obtidos reafirmam exemplos de pequenas variações estruturais resultantes de inversões e translocações Robertsonianas, como principais mecanismos de diversificação cariotípica, bem como um padrão evolutivo mais conservado numericamente, também observado em representantes de Echeneidae do Atlântico em relação ao Pacífico. A presença de RONs múltiplas, observadas nas espécies T. goodei e C. chrysurus parecem representar um caráter derivado na família Carangidae. Os resultados para as espécies O. ruber e A. probatocephalus sugerem a presença de possíveis barreiras geográficas ou climáticas entre suas populações no NE do Brasil, quando comparada com a região SEDissertação Estudos in silico da proteína AlkB e prospecção de bactérias alcanotróficas em solos da bacia petrolífera potiguar(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-28) Pereira, Matheus Silva; Blaha, Carlos Alfredo Galindo; ; http://lattes.cnpq.br/2307806644081146; ; http://lattes.cnpq.br/4843315104775965; Araújo, Magnólia Fernandes Florêncio de; ; http://lattes.cnpq.br/4511989641459455; Oliveira, Valéria Maia de; ; http://lattes.cnpq.br/3886687872358496Alguns microrganismos de ecossistemas virgens são capazes de utilizar petróleo como fonte de carbono e energia. O conhecimento dessa biodiversidade microbiana pode revelar vias metabólicas microbianas para utilizar alcanos que venham a ter importância biotecnológica. Os objetivos do presente trabalho são: i) realizar estudos in silico da proteína AlkB visando obter subsídios para a compreensão do mecanismo de seletividade na utilização de alcanos em bactérias Gram positivas e Gram negativas; ii) prospectar e avaliar a resposta de comunidades microbianas alcanotróficas de solos e mangue da BPP RN e solo da Mata Atlântica na Reserva Horto Dois Irmãos-PE utilizando o gene alkB como biomarcador molecular, e as técnicas de PCR e PCR-DGGEDissertação Caracterização genética e in situ de Gossypium barbadense na região norte do Brasil(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-27) Almeida, Vanessa Cavalcante de; Barroso, Paulo Augusto Vianna; ; http://lattes.cnpq.br/2493954146850909; ; http://lattes.cnpq.br/0012158715722566; Silva Filho, João Luis da; ; http://lattes.cnpq.br/0608088933335198; Macedo, Cristiane Elizabeth Costa de; ; http://lattes.cnpq.br/8290207282547590O Brasil é considerado um dos centros de diversidade da espécie Gossypium barbadense. Acredita-se que grande parte da variabilidade genética de G. barbadense esteja sendo perdida, em virtude de problemas econômicos, culturais e agrícolas. O primeiro passo para reduzir a perda de diversidade e estabelecer estratégias de conservação in situ é realizar um diagnóstico de como a espécie se encontra nos locais em que ocorre. Os objetivos deste trabalho foram identificar populações de Gossypium presentes no estado do Pará e Amapá, caracterizá-Ias, determinar os principais riscos e coletar acessos para armazenamento em bancos de germoplasma. Foram realizadas expedições em Novembro de 2004, e a caracterização in situ de G. barbadense foi realizada por entrevista do proprietário da planta e da análise do ambiente em que as plantas estavam inseridas. Foram coletadas 179 plantas em 22 municípios no estado do Pará e 117 plantas em nove municípios no estado do Amapá. A maioria das plantas pertence à espécie G. barbadense (98% no Amapá e 94% no Pará). As plantas ocorrem em fundo de quintal, beira de estrada e de modo espontâneo, sendo as de fundo de quintal bem mais abundantes (97% no Amapá e 95% no Pará) e mantidas com a finalidade principal de serem usadas como plantas medicinais. Os moradores não possuem o hábito de armazenar e beneficiar as sementes, no Pará apenas 1 % dos proprietários relatou armazenar as sementes e no Amapá esse índice foi de 11 %. A maioria das plantas coletadas tinha de dois a três anos de idade (58% no Amapá e 93% no Pará). Conclui-se então que G. barbadense é a espécie mais difundida nos dois estados e que são encontradas em fundo de quintal. No estado do Amapá predomina a variedade botânica barbadense ou Quebradinho, enquanto que no Pará predomina a variedade brasiliense ou Rim-de-boi. Não foram encontradas plantas em ambientes naturais nos dois estados, portanto a criação de reservase o emprego de outros métodos convencionais de manutenção in situ não parecem ser aplicáveis a G. barbadense em ambos os estados. A adequada conservação dessas espécies deve ser realizada em coleções de germoplasma mantidas ex situDissertação Estrutura genética de populações de Amphobotrys ricini, agente causal do mofo cinzento da mamoneira(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2007-02-22) Bezerra, Cintia de Sousa; Vidal, Márcia Soares; ; http://lattes.cnpq.br/3036544314910366; ; http://lattes.cnpq.br/5297087334987268; Suassuna, Nelson Dias; ; http://lattes.cnpq.br/4344026717541727; Molina, Wagner Franco; ; http://lattes.cnpq.br/8437464961129518O mofo cinzento, causado pelo fungo Amphobotrys ricini, é um dos principais problemas fitossanitários da cultura mamoneira. Esta doença causa prejuízos a cultura podendo levar à perda total da produção caso medidas de controle não sejam implementadas a tempo. A determinação da estrutura genética de populações de patógenos e o monitoramento sistemático das populações com o intuito de compreender a dinâmica de seus aspectos genéticos é importante para que programas de melhoramento visando a resistência durável tenham êxito. O controle químico do patógeno também é necessário, entretanto, não existem fungicidas registrados para o controle da doença. O objetivo deste trabalho foi determinar a variabilidade genética entre e dentro de subpopulações de A. ricini no estado da Paraíba, empregando marcadores moleculares do tipo RAPD e analisar a sensibilidade de isolados de A. ricini aos fungicidas carbendazim e azoxistrobina. Para a determinação da estrutura genética foram analisados 23 isolados de duas subpopulações (SPs), sendo a SP1 formada por isolados coletados nos municípios de Campina Grande, Lagoa Seca e Esperança e a SP2 com isolados oriundos dos municípios de Areia, Remígio, Solânea e Alagoa Nova. Amostras de DNA purificadas dos isolados foram submetidas a reações RAPD com 22 oligonucleotídeos da série OPERON, gerando 80 fragmentos polimórficos que foram analisados pelo programa PopGene. Para verificar a sensibilidade a fungicidas, 30 isolados de duas populações, sendo uma da Paraíba e outra de Alagoas foram testados contra o Carbendazim avaliando-se o crescimento micelial em meio V8 acrescido do fungicida nas dosagens 0, 0.01, 0.1, 1, 10 e 100 µg/ml; e azoxistrobina avaliando-se a germinação de esporos. Os dados foram analisados pelo procedimento PROBIT do pacote estatístico SAS que calculou a dosagem necessária para inibir 50% do crescimento micelial (DL50). A diversidade genética total (Ht=0,293) é devida à diversidade genética dentro das SPs (Hs=0,271). O número de migrantes foi estimado em 6,15 indivíduos a cada geração entre as subpopulações. A fração da variação genética distribuída entre as subpopulações Gst foi 0,075. Houve baixa diferenciação entre as subpopulações com base na média de identidade genética (Nei, 1973) entre as subpopulações em todos os locos analisados (0,9468). Os valores de DL50 variaram entre 0,026 e 0,316 µg/ml para carbendazim e 0,0036 e 0,168 µg/ml para azoxistrobina. Neste estudo, há evidências de que a estrutura genética da população de A. ricini no estado da Paraíba seja clonal e que há intensa migração e que os isolados da Paraíba e Alagoas são sensíveis a carbendazim e azoxistrobinaDissertação Estudos ecogenômicos e bioprospectivos de Shewanella spp(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2009-03-26) Silva, Amanda Lys dos Santos; Blaha, Carlos Alfredo Galindo; ; http://lattes.cnpq.br/2307806644081146; ; http://lattes.cnpq.br/4188154960985978; Silva, Márcio Luis Busi da; ; http://lattes.cnpq.br/9432231379935053; Corso, Gilberto; ; http://lattes.cnpq.br/0274040885278760Bactérias dos gêneros Shewanella e Geobacter são os microrganismos redutores de ferro mais estudados. Esse interesse ocorre particularmente devido aos seus sistemas de transporte de elétrons e contribuição em alguns problemas industriais e ambientais, tais como corrosão de oIeodutos, bioenergia e biorremediação de locais contaminados com petróleo. O presente estudo foi tocado em duas partes: a primeira é um estudo ecogenômico comparativo de ShewanelIa spp. com genomas seqüenciados, e a segunda é um trabalho metagenômico experimental para detectar Shewanella redutoras de ferro através de PCR-DGGE de um gene metabólico. O estudo in silico resultou em correlação positiva entre o número de cópias 16S rDNA e tamanho do genoma em ShewaneIla spp., com agrupamentos de rrn. próximo à origem de replicação. Desta maneira, o gênero é inferido como oportunista. Não existem genomas compactos e o tamanho de suas sequências variam de 4306142 nt em S. amazonensis SB2B até 5935403 nt em S. woodyi ATCC 51908, sem correlação com a faixa de temperatura característica de cada espécie. Sequências intragenômicas de 16S rDNA possuem pouca divergência. mas razoável para resultar em diferentes árvores filogenéticas. dependendo da sequência que é escolhida para comparação. Para a detecção moIecuIar de ShewanelIa redutoras de ferro, é proposto o gene mtrB como um novo biomarcador, por ser codante de uma proteína fundamental na reduçao de Fe (III). Os primers específicos foram desenhados e avaliados in silico e resultou em um fragmento de 360 pb. No segundo estudo, esses primers foram testados em . amostra genômica de S. oneidensis MR-1, amplificando a região esperada. Depois desse resultado favorável, o par de primers foi utilizado como ferramenta para acessar as comunidades redutoras de ferro do gênero ShewanelIa sob um stress ambiental - contaminação com óleo cru em sedimento de mangue, no Estado do Grande do Norte (Brasil). Os primers apresentaram alta especificidade e as reações resultaram em banda única de amplificação das amostras metagenômicas. O perfil obtido no DGGE revelou variação temporal de ShewanelIa spp. nas amostras analisadas. Os resultados apresentados mostram a defecção de um grupo de microrganismos biotecnologicamente importante. ShewaneIla spp. redutoras de ferro, usando um gene metabólico como alvo. Concluiu-se que existem oito ou mais sequências 16S rDNA no gênero ShewaneIla, com pouca divergência entre elas que afetam a filogenia; o par de primers desenhados para amplificar sequências mtrB é uma alternativa viável para detectar Shewanella redutoras de ferro em abordagens metagenômicas; tais bactérias estão presentes no sedimento de mangue analisado, com variações temporais nas amostras. Este é o primeiro estudo experimental que examina Shewanella redutoras de ferro em um experimento metagenômico de sedimento de mangue submetido a contaminação por óleo através de um gene metabólicoDissertação caracterização in situ e estrutura genética de populações de Gossypium mustelinum(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2009-02-27) Alves, Milena Ferreira; Barroso, Paulo Augusto Vianna; Hoffmann, Lúcia Vieira; ; http://lattes.cnpq.br/1552220402943995; ; http://lattes.cnpq.br/2493954146850909; ; http://lattes.cnpq.br/9738264326712552; Freire, Eleusio Curvelo; ; http://lattes.cnpq.br/2400072395820099; Nóbrega, Márcia Barreto de Medeiros;Gossypium mustelinum Miers ex Watt é a única espécie de algodão nativa do Brasil. É uma espécie endêmica do semi-árido nordestino do país, ocorrendo próximo a fontes de água mais duradouras. Os riscos para conservação in situ das populações estão associados a interferência humana em seu habitat, principalmente devido ao excessivo pastejo por bovinos e caprinos, além do desmatamento em matas ciliares. Estabelecer estratégias eficazes de conservação in situ depende da realização de um diagnóstico da espécie em seu ambiente natural, e do conhecimento acerca da estrutura genética das populações. Os objetivos deste trabalho foram: i) determinar as condições in situ de duas populações presentes em rios da bacia do Rio Paraguaçu no estado da Bahia, ii) avaliar a estrutura e variabilidade genética presente em ambas as populações, iii) e estabelecer estratégias de conservação in situ e ex situ. Foram realizadas coletas em novembro de 2007, quando foi realizada a caracterização in situ de G. mustelinum. Marcadores SSR foram usados para analisar 218 genótipos de duas populações, localizadas nos rios Tocó e Capivara. As freqüências alélicas, a heterozigozidade e as estatísticas F foram estimadas. Todas as plantas foram classificadas como selvagens e nativas, e nenhuma evidencia de exploração antrópica foi observada. As populações apresentavam diferentes condições de conservação in situ. Poucas plantas foram encontradas em locais onde havia prática de pecuária extensiva, um indício de que os danos causados a plantas jovens sejam maiores, comprometendo a renovação das populações. Em contraste, populações foram encontradas em adequadas condições de preservação quando os danos causados pela ação antrópica eram pequenos ou inexistentes. Os 14 pares de primers SSR amplificaram 17 locos com número médio de 5 alelos por loco (85 alelos no total). O alto índice de endogamia estimado (FIS=0,808) e a baixa quantidade de heterozigotos (Ho=0,093) indicam que as populações propagam-se preferencialmente por autofecundação, geitonogamia e cruzamentos entre indivíduos aparentados. A diversidade genética total foi alta (HE=0,482) e a diferenciação entre as populações foi muito elevada (FST=0,328). No mínimo duas sub-populações devem ser preservadas em cada rio para uma adequada conservação in situ. Ações de preservação das matas ciliares e que impeçam o acesso do gado às populações devem ser implementadas, erguendo cercas próximas as plantas. Não é possível prever se as sugestões propostas para preservação in situ serão implementadas. Coletas devem ser intensificadas e ações para preservação ex situ devem ser realizadas para conservação da diversidade genética presente nesta espécie nativa do BrasilDissertação Análise das mudanças no perfil protéico durante o estresse oxidativo in vivo e atuação da MutY-Glicosilase em respostas celulares(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2009-02-26) Oliveira, Ana Helena de Sales; Lima, Lucymara Fassarela Agnez; ; http://lattes.cnpq.br/1083882171718362; ; http://lattes.cnpq.br/2496676717434734; Uchoa, Adriana Ferreira; ; http://lattes.cnpq.br/6644671747055211; Machado, Carlos Renato; ; http://lattes.cnpq.br/6306925202374274; Lajus, Tirzah Braz Petta; ; http://lattes.cnpq.br/9979644969955564Espécies reativas de oxigênio (EROs) são produtos do metabolismo celular capazes de reagir com biomoléculas, como proteínas, lipídeos e ácido nucléico. Essas reações podem causar modificações deletérias para a célula. Fotossensibilizadores como o azul de metileno (MB), são capazes de produzir EROs, como o oxigênio singlete (1O2), uma das formas mais reativas do oxigênio molecular. O 1O2 é capaz de oxidar guaninas, gerando lesões no DNA, como 7,8-dihydro-8-oxoguanine (8-oxoG), o mais frequente produto da oxidação, que durante a replicação pode emparelhar com adenina levando à mutações. Foi de interesse desse estudo, caracterizar a citotoxicidade, o potencial mutagênico e o padrão de expressão protéica, durante o estresse oxidativo induzido pelo MB, usando como modelo cepas de Escherichia coli proficiente em reparo e deficientes em MutY-Glicosilase, uma enzima de reparo envolvida na correção de pares 8-oxoG:Adenina. Essas cepas foram tratadas com MB em presença ou ausência de luz. O crescimento, sobrevivência, a taxa de mutagênese e padrão de síntese protéica, foram analisados. O tratamento afetou o crescimento bacteriano, induzindo morte celular, mutagênese, e mudanças no padrão de síntese protéica em ambas as cepas. Entretanto a cepa deficiente em MutY mostrou uma maior sensibilidade em relação a cepa proficiente. Adicionalmente, a cepa deficiente em MutY apresentou um padrão de expressão protéica diferenciado quando comparado com a cepa proficiente. Esses resultados sugerem o envolvimento da MutY na correção de lesões de DNA não caracterizadas e que a ausência de MutY induz alterações no padrão de expressão protéicaDissertação Inferências carioevolutivas sobre grupos crípticos de peixes marinhos e estuarinos(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2009-02-26) Araújo, Washington Candeia de; Molina, Wagner Franco; ; http://lattes.cnpq.br/8437464961129518; ; http://lattes.cnpq.br/3939811669371707; Blaha, Carlos Alfredo Galindo; ; http://lattes.cnpq.br/2307806644081146; Sousa, Marcos Antonio Nóbrega de; ; http://lattes.cnpq.br/4412109117021331Estudos citogenéticos têm revelado uma grande diversidade até então não detectada em diversas famílias de peixes. Muitos destes grupos, sobretudo os que exibem grande diversidade, como Perciformes e Siluriformes, possuem espécies de difícil caracterização morfológica, chamadas de espécies crípticas, muitas vezes só detectadas através de análises cariotípicas, as quais revelam variações interespecíficas marcantes quanto ao número e estrutura cromossômica. Desta forma, o presente trabalho pretende contribuir para o conhecimento citogenético de espécies marinhos e estuarinos, que, por não serem exploradas comercialmente ou terem hábitos de vida peculiares são pouco estudadas quanto aos seus aspectos genéticos. Assim, análises cariotípicas foram desenvolvidas em uma espécie da família Apogonidae (Perciformes), em duas espécies de bagres marinhos da família Ariidae (Siluriformes), além de uma espécie de siluriforme estuarino, Paurachenipterus galeatus (Auchenipteridae) através de bandamento C, Ag-RONs, coloração com DAPI e CMA3, bem como pela FISH (Fluorescent in situ hibridization), utilizando sondas ribossomais 5S e 18S. Os resultados aqui apresentados indicam grande diversidade inerente a estes grupos. Outras abordagens (análises morfológicas e ferramentas moleculares) permitirão obter maior entendimento acerca da diversidade biológica da ictiofauna brasileiraDissertação Análise citogenética de células-tronco derivadas do subendotélio da veia umbilical humana(Universidade Federal do Rio Grande do Norte, 2009-02-26) Duarte, Denise de Medeiros; Medeiros, Sílvia Regina Batistuzzo de; ; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781004Y8; ; http://lattes.cnpq.br/4683071633811092; Moura, Carlos Eduardo Bezerra de; ; http://lattes.cnpq.br/4717410137206021; Santos, Neide; ; http://lattes.cnpq.br/2906973201323652Células-tronco mesenquimais (CTMs) são conhecidas como uma população de células capazes de se proliferar e diferenciar em múltiplos tecidos de origem mesodérmico incluindo osso, cartilagem, músculo, ligamento, tendão, gordura e estroma. Das diversas aplicações do estudo das CTMs podem-se ressaltar as técnicas terapêuticas como a regeneração óssea guiada através da implantação de CTMs no local afetado, sem a necessidade de enxertos ósseos, usando o titânio como veículo. O processo de criopreservação é essencial para a manutenção de cultivos celulares, uma vez que a linhagem celular é congelada, a mesma pode ser mantida em nitrogênio líquido por tempo indeterminado e depois descongelado para fins experimentais ou terapêuticos. Deste modo, o objetivo desse trabalho foi isolar uma população de células-tronco mesenquimais derivadas do subendotélio da veia umbilical humana (CTMs-SVUH) para avaliar através da análise citogenética a possibilidade de surgimento de alterações cromossômicas em duas diferentes situações: CTMs-SVUH frente ao processo de criopreservação e CTMs-SVUH cultivadas sobre a superfície de titânio. Análise por citometria de fluxo revelou que, esta população celular foi positiva para os marcadores CD29, CD73 e CD90, mas foram negativas para marcadores de linhagem hematopoiético como, CD14, CD34 e CD45 e demonstraram capacidade de diferenciação osteogênica. Os cromossomos obtidos a partir da cultura primária de CTMs-SVUH foram analisados através da técnica de bandeamento GTW, e os resultados descritos conforme orientações do ISCN 2005. Não houve o aparecimento de alterações cromossômicas clonais nas CTMs-SVUH nas diferentes situações analisadas. Entretanto um dos cordões apresentou uma inversão paracêntrica balanceada, provavelmente uma alteração citogenética constitucional, que esteve presente antes e depois das situações experimentais a que as CTM-SVUH foram submetidas